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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003867`

染色体: Chr03 坐标: 57772255-57776059 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003867`
名称	SmilChr03G003867
描述	uncharacterized SmilChr03G003867
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57772255 - 57776059 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014699`
GeneID	`131014699`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014699`
原始查询	`SmilChr03G003867`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3'-5' exonuclease domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832504]; symbol=AT5G24340; hit=AT5G24340; species=arabidopsis; confidence=high
产物	3'-5' exonuclease domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832504]; symbol=AT5G24340; hit=AT5G24340; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G24340` (AT5G24340) 3'-5' exonuclease domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832504] identity=60.8; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0452400` - identity=50.8; qcov=1.02; evalue=1.67e-180; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0006139 (nucleobase-containing compound metabolic process); GO:0008408 (3'-5' exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF01612 (DNA_pol_A_exo1); PF01927 (Mut7-C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014699

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798736.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798736.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798736.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798736.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798736.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57772715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:57774085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,D4
`Chr3:57774165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:57774360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B14
`Chr3:57775251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798736.1

516 aa

258

516

DNA_pol_A_exo1

Mut7-C

PF01612 DNA_pol_A_exo1 17-208 aa PF01927 Mut7-C 345-501 aa

XP_057798737.1

516 aa

258

516

DNA_pol_A_exo1

Mut7-C

PF01612 DNA_pol_A_exo1 17-208 aa PF01927 Mut7-C 345-501 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798736.1`	Pfam	`PF01612`	DNA_pol_A_exo1	Domain	17	208	1.3e-20	74.7	3'-5' exonuclease
`XP_057798736.1`	Pfam	`PF01927`	Mut7-C	Domain	345	501	2.1e-39	135.7	Mut7-C RNAse domain
`XP_057798737.1`	Pfam	`PF01612`	DNA_pol_A_exo1	Domain	17	208	1.3e-20	74.7	3'-5' exonuclease
`XP_057798737.1`	Pfam	`PF01927`	Mut7-C	Domain	345	501	2.1e-39	135.7	Mut7-C RNAse domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942754.1
GAAAACAAAAAATAATTAAATTTTAGAGCCCAATAAGCCCATATATGAGAAAAGGAGACAATTTTGATTTACAATCTTTAGTAATTTATTGATGGAAGTCCAAAAACGAGGGCTTTCGATCCACCTAATCACCTCCCATGACTCGCCCGAGTTCGCTCACCTGAACCACGCGTTGACTCACTCATTCGTCATCGGGCTCGACGCGGAATGGAAACCCAATCGCCAGGCTTCCACCTTCCCCGCCGTCTCCCTACTCCAAA...

XM_057942753.1
AAGGAGACAATTTTGATTTACAATCTTTAGTAATTTATTGATGGAAGTCCAAAAACGAGGGCTTTCGATCCACCTAATCACCTCCCATGACTCGCCCGAGTTCGCTCACCTGAACCACGCGTTGACTCACTCATTCGTCATCGGGCTCGACGCGGAATGGAAACCCAATCGCCAGGCTTCCACCTTCCCCGCCGTCTCCCTACTCCAAATCGCATGCCAACTCGTCAACGCGCCCGAGTTGGACTCGGACGAGTCGCCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014699
ATGGAAGTCCAAAAACGAGGGCTTTCGATCCACCTAATCACCTCCCATGACTCGCCCGAGTTCGCTCACCTGAACCACGCGTTGACTCACTCATTCGTCATCGGGCTCGACGCGGAATGGAAACCCAATCGCCAGGCTTCCACCTTCCCCGCCGTCTCCCTACTCCAAATCGCATGCCAACTCGTCAACGCGCCCGAGTTGGACTCGGACGAGTCGCCGATTTTCCTCATCGATCTCCAAACCATTCACATGCCCCCGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798736.1
MEVQKRGLSIHLITSHDSPEFAHLNHALTHSFVIGLDAEWKPNRQASTFPAVSLLQIACQLVNAPELDSDESPIFLIDLQTIHMPPVYELLNQVFVAPNVLKLGFRFKQDLVYLSSTFCERDCAPGFDRVEPFIDISAIYNHLQTKQPGRRIPKQTKSLATICEEILGISLSKELQCSDWSQRPLTEEQKTYAAADAHCLVKIFNLFHAKVVREGKSSQPSDVGPGAGLKQILEKSSGDNMVTRAALVEASNMTRKIMPE...

XP_057798737.1
MEVQKRGLSIHLITSHDSPEFAHLNHALTHSFVIGLDAEWKPNRQASTFPAVSLLQIACQLVNAPELDSDESPIFLIDLQTIHMPPVYELLNQVFVAPNVLKLGFRFKQDLVYLSSTFCERDCAPGFDRVEPFIDISAIYNHLQTKQPGRRIPKQTKSLATICEEILGISLSKELQCSDWSQRPLTEEQKTYAAADAHCLVKIFNLFHAKVVREGKSSQPSDVGPGAGLKQILEKSSGDNMVTRAALVEASNMTRKIMPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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