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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003869`

染色体: Chr03 坐标: 57798026-57800616 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003869`
名称	SmilChr03G003869
描述	uncharacterized SmilChr03G003869
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57798026 - 57800616 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019056`
GeneID	`131019056`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019056`
原始查询	`SmilChr03G003869`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=37.7; qcov=0.789; evalue=3.2e-18; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=55.9; qcov=0.583; evalue=2.68e-33; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019056

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803719.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803719.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803719.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803719.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803719.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57798072`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A5,B1,B101,B107,B127,B32,B40,B45,B54,B95,C63,C7,C71,C73,C79,C82,D11,D3,D6
`Chr3:57800176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr3:57800259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A23,A7,B100,B109,B121,B130,B2,B27,B41,B43,B45,B54,B56,B65,B78,C18,C2,C35,C47
`Chr3:57800366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr3:57800380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B84,C80
`Chr3:57800458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C34
`Chr3:57800506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr3:57800602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B28,C28,C80
`Chr3:57800605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr3:57800606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803719.1

175 aa

175

DUF8418

PF28509 DUF8418 60-98 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803719.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	60	98	3.5e-20	72.2	Domain of unknown function (DUF8418)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947736.1
ATGGCGGAATCCGACCACGGTTCTTCGTCTGATTCATCCGACGGTGTAGCTAATGCGATCATGGAGGAGATAGAGTTGCATAATCAAGTGCTTGCTCACATCTATGGCCAGCCGGCTCCGGAGGCGGGACGTGTGAAACGTCCCCGATCTTACGTCCACCGTGATAGAGAGGAAGCCCACCTACGTCTTATGCAAGACTACTTCCACGACAATCCGACGTACGGACCTACATTTTTCCGGCGGCGTTTTCGAATGCAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019056
ATGGCGGAATCCGACCACGGTTCTTCGTCTGATTCATCCGACGGTGTAGCTAATGCGATCATGGAGGAGATAGAGTTGCATAATCAAGTGCTTGCTCACATCTATGGCCAGCCGGCTCCGGAGGCGGGACGTGTGAAACGTCCCCGATCTTACGTCCACCGTGATAGAGAGGAAGCCCACCTACGTCTTATGCAAGACTACTTCCACGACAATCCGACGTACGGACCTACATTTTTCCGGCGGCGTTTTCGAATGCAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803719.1
MAESDHGSSSDSSDGVANAIMEEIELHNQVLAHIYGQPAPEAGRVKRPRSYVHRDREEAHLRLMQDYFHDNPTYGPTFFRRRFRMQKELFLRIVEAVQGVDTFFHMTTDAIGRDSLSPLQKCTSAIRQLATGLSADTFDEYLRVADSTGRWLEESEKWEMDVCGEAPDSDELLDK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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