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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003872`

染色体: Chr03 坐标: 57826259-57833777 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003872`
名称	SmilChr03G003872
描述	protein MATERNALLY EXPRESSED GENE 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57826259 - 57833777 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014725`
GeneID	`131014725`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014725`
原始查询	`SmilChr03G003872`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MATERNALLY EXPRESSED GENE 5-like
产物	protein MATERNALLY EXPRESSED GENE 5-like
Arabidopsis	`AT1G21320` (AT1G21320) nucleic acid/nucleotide binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838729] identity=44.1; qcov=1.09; evalue=9.93e-52; confidence=medium
Rice	`Os06g0127500` - identity=54.1; qcov=0.881; evalue=1.79e-64; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014725

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798782.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057798782.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057798782.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798782.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798782.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57827546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:57827551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B117,C7
`Chr3:57827560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C81,D7
`Chr3:57827635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,D4
`Chr3:57828061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr3:57829283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798782.1

235 aa

118

235

RRM_1

PF00076 RRM_1 137-207 aa

XP_057798783.1

235 aa

118

235

RRM_1

PF00076 RRM_1 137-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798782.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	137	207	6.6e-11	42.6	RNA recognition motif
`XP_057798783.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	137	207	6.6e-11	42.6	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098306.1
GATAAAACCCAAAAATACCAAGAAAGAAACAAGTTAAAGAGAGAAAAGGAGGCAAACGAAGTTGAGATTAAATAGAAATTATAATAAAAAAGCCTCGCAATTCACGCGATATAAATATGTACAAACTCAGAATTTTGCAGTGAAAGAAAGCAGCGTTTTACCGTTCCTATATATCTACTCTGTCTGAAAATCGGAAACCAAAACCCTAGTTTTTTCAATTGGTTTGAATTTACCCCCCTTTCCTTGTCGAATTCTACATT...

XR_009098305.1
CCTCGCAATTCACGCGATATAAATATGTACAAACTCAGAATTTTGCAGTGAAAGAAAGCAGCGTTTTACCGTTCCTATATATCTACTCTGTCTGAAAATCGGAAACCAAAACCCTAGTTTTTTCAATTGGTTTGAATTTACCCCCCTTTCCTTGTCGAATTCTACATTCTCACTACCAATCAACAATGGCGGACGCTTTCTGGAGGTACGGTGACAACAGGCAGCCGGCGGTGTCGCTTCCAGCTCAGATGGTTGCGAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014725
ATGGCGGACGCTTTCTGGAGGTACGGTGACAACAGGCAGCCGGCGGTGTCGCTTCCAGCTCAGATGGTTGCGAAACGGCCTCGTTCCGAGTTTGAGATGCCAAGTGGACAAGATACGTCAAGCTACTATATTCCTGGCAATGAAAGGGCAGGAAATCTTGTCGCTAGAGATACCGACTCCGTCAATGCATCATATGAACGCTACTTGCGTACTTTGCAAGTTCCATCATATGGTGGCCAAACTGGAAGACCTGCTATTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798782.1
MADAFWRYGDNRQPAVSLPAQMVAKRPRSEFEMPSGQDTSSYYIPGNERAGNLVARDTDSVNASYERYLRTLQVPSYGGQTGRPAIGGLDGVHEIDDLRVLGLVQSGAAAAAAAQSRLMGVGGRPEISLPPDASSTLFVEGLPGNCTRREVSHIFRPFVGYKEVRLVTKAPRHPGGDPVVLCFVDFESPAHAATAMDALQGYIFDEHDRESGHLRVQFARNPPGPRLGGGHRGNR

XP_057798783.1
MADAFWRYGDNRQPAVSLPAQMVAKRPRSEFEMPSGQDTSSYYIPGNERAGNLVARDTDSVNASYERYLRTLQVPSYGGQTGRPAIGGLDGVHEIDDLRVLGLVQSGAAAAAAAQSRLMGVGGRPEISLPPDASSTLFVEGLPGNCTRREVSHIFRPFVGYKEVRLVTKAPRHPGGDPVVLCFVDFESPAHAATAMDALQGYIFDEHDRESGHLRVQFARNPPGPRLGGGHRGNR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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