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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003876`

染色体: Chr03 坐标: 57873352-57877501 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003876`
名称	SmilChr03G003876
描述	uncharacterized SmilChr03G003876
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57873352 - 57877501 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014703`
GeneID	`131014703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014703`
原始查询	`SmilChr03G003876`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828886]; symbol=AT4G27720; hit=AT4G27720; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828886]; symbol=AT4G27720; hit=AT4G27720; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G27720` (AT4G27720) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828886] identity=87.6; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0114800` (OSJNBa0090O10.18) - identity=81.5; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0015098 (molybdate ion transmembrane transporter activity); GO:0015689 (molybdate ion transport); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF05631 (MFS_5); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057798741.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057798741.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057798741.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057798741.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798741.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57873772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C7
`Chr3:57873776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B114,B17,B73,C30
`Chr3:57873987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:57874420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr3:57874633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B86,C35
`Chr3:57874781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:57875119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B60,C27
`Chr3:57875154`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B49,B60,C27
`Chr3:57875154`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B49,B60,C27
`Chr3:57875932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B131
`Chr3:57875953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B71
`Chr3:57877239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,C62,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798741.1

462 aa

231

462

MFS_5

MFS_1

PF05631 MFS_5 4-359 aa PF07690 MFS_1 43-394 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798741.1`	Pfam	`PF05631`	MFS_5	Family	4	359	5.7e-186	618.3	Sugar-tranasporters, 12 TM
`XP_057798741.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	43	394	4e-18	66.2	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942758.1
GGCTAAGCAGCGTAGCTACTTTTGCACACAGAAGCACACTATAGTGTGTGTGAATGTGCATATACTTATATACGGAATACATCCTAACCTCACTGAGGAAATTTCGAAAACTTTCTCGCTCTTGTTTCATTTTTCGTTTCTTTTTCTCTCAAGGGGGAAAGAGTGGAGGTGAGAGAGAATGGAGATTTTCTACTACATGGTGTTCGGTGGGCTGGCCGCGGTGGTGGCGGCGCTGGAGCTGAGCAAAAGTAACAAGGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014703
ATGGAGATTTTCTACTACATGGTGTTCGGTGGGCTGGCCGCGGTGGTGGCGGCGCTGGAGCTGAGCAAAAGTAACAAGGATCGGGTTAACACGTCTTCAGCTTTCAATTCGTTCAAGAACAATTACCTGCTCGTCTACTCGCTCATGATGGCTGGTGACTGGTTGCAGGGTCCATACGTTTACTACCTCTACAGTACATATGGTTTCGGGAAGGGTGAAATTGGACAGCTCTTTATTGCTGGATTTGGCTCTTCCATGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798741.1
MEIFYYMVFGGLAAVVAALELSKSNKDRVNTSSAFNSFKNNYLLVYSLMMAGDWLQGPYVYYLYSTYGFGKGEIGQLFIAGFGSSMLFGTIVGSLADKQGRKRACVTYCITYILSCITKHSPQYKILMVGRILGGIATSLLFSAFESWLVAEHFKRGFEQQWLSVTFSKAIFLGNGLVAIVAGLFGNLLVDSFNLGPVSPFDAAAIFLAIGMAVILSSWSENYGDPSESKDLLTQFKGAAVAIASDEKIALLGAIQSLFE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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