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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003881`

染色体: Chr03 坐标: 57900534-57902743 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003881`
名称	SmilChr03G003881
描述	LIM domain-containing protein PLIM2c-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57900534 - 57902743 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019057`
GeneID	`131019057`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019057`
原始查询	`SmilChr03G003881`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LIM domain-containing protein PLIM2c-like
产物	LIM domain-containing protein PLIM2c-like
Arabidopsis	`AT3G61230` (PLIM2c) GATA type zinc finger transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825295] identity=71.4; qcov=0.424; evalue=9.05e-23; confidence=low
Rice	`Os02g0641000` (OsPLIM2a) - identity=56.7; qcov=0.508; evalue=4.14e-21; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0015629 (actin cytoskeleton); GO:0051015 (actin filament binding); GO:0051017 (actin filament bundle assembly)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019057

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057803720.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803720.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803720.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803720.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803720.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57900821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A21,B40,C34
`Chr3:57900839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B137,C11,C69
`Chr3:57900871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:57900885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr3:57900886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:57900901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:57900906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B46,B8,B9,C59
`Chr3:57900908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B61,C65
`Chr3:57900929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr3:57900940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:57900950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B125,B130,B21,C2
`Chr3:57900951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947737.1
ATGGAGTTTTGGAGAGTTGAAGTTAAGGTTGGGAAATTCTTAAGTCGCCGGCCACCGCCTCCGCCGCGAACCACCACCACCGCGACGCACAGCGGCAGAGGATCTCTGGAGGCGGTGGAGGATTTCGAATGCGCCCATGGCGGCTGCGCGCTGACGCACTCTTCCTACGCTGCTCTCGACGGGATCCTCTACTGCAAGCACCACTTCCAGCAGCTTTTCATGGAGAAAGGCAACTACCAGCATGTTATCGAGGCTGCGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019057
ATGGAGTTTTGGAGAGTTGAAGTTAAGGTTGGGAAATTCTTAAGTCGCCGGCCACCGCCTCCGCCGCGAACCACCACCACCGCGACGCACAGCGGCAGAGGATCTCTGGAGGCGGTGGAGGATTTCGAATGCGCCCATGGCGGCTGCGCGCTGACGCACTCTTCCTACGCTGCTCTCGACGGGATCCTCTACTGCAAGCACCACTTCCAGCAGCTTTTCATGGAGAAAGGCAACTACCAGCATGTTATCGAGGCTGCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803720.1
MEFWRVEVKVGKFLSRRPPPPPRTTTTATHSGRGSLEAVEDFECAHGGCALTHSSYAALDGILYCKHHFQQLFMEKGNYQHVIEAARKSTVENDANVAAAAAAAEEGEAAGEEDGEAKADPDEPESEAKAED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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