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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003889`

染色体: Chr03 坐标: 57961116-57963618 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003889`
名称	SmilChr03G003889
描述	pyridoxal reductase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57961116 - 57963618 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014746`
GeneID	`131014746`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014746`
原始查询	`SmilChr03G003889`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pyridoxal reductase, chloroplastic
产物	pyridoxal reductase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G53580` (PLR1) NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835440] identity=70.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0517400` - identity=72.8; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004033 (GO:0004033); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	smil00750 (Vitamin B6 metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00248 (Aldo_ket_red)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014746

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798811.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057798811.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798811.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798811.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798811.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57961559`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A15,B136,B32
`Chr3:57961559`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A15,B136,B32
`Chr3:57961586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B24,B35,B72,D11
`Chr3:57961787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B123,B20,B68,C31
`Chr3:57962001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:57962165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B111,B51,B68
`Chr3:57962356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	56	A11,A14,A2,A22,A24,A25,A3,A5,B105,B106,B110,B114,B118,B120,B121,B124,B13,B133,B139,B20,B22,B30,B32,B44,B45,B53,B56,B57,B60,B63,B65,B77,B80,B81,B83,B92,B96,C15,C16,C25,C28,C38,C42,C47,C5,C52,C6,C60,C62,C64,C66,C7,C72,C73,C77,C9
`Chr3:57962571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr3:57963079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B59,C5
`Chr3:57963081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,D5
`Chr3:57963111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	37	A1,A14,A15,A8,B112,B120,B136,B2,B20,B22,B26,B31,B33,B40,B48,B49,B58,B59,B65,B67,B90,B92,C17,C21,C3,C33,C42,C5,C55,C58,C64,C70,C71,C76,C78,C82,C86
`Chr3:57963174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798811.1

370 aa

185

370

Aldo_ket_red

PF00248 Aldo_ket_red 54-354 aa

XP_057798812.1

370 aa

185

370

Aldo_ket_red

PF00248 Aldo_ket_red 54-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798811.1`	Pfam	`PF00248`	Aldo_ket_red	Domain	54	354	1.1e-59	202.7	Aldo/keto reductase family
`XP_057798812.1`	Pfam	`PF00248`	Aldo_ket_red	Domain	54	354	1.1e-59	202.7	Aldo/keto reductase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942828.1
CAAATTAAAAAAAAGATATAACTATTTTCAGTTGGTGGCGCCTTTGCTCCTTCCATCTCTTATCCATCTTCAAAGACACCTTATTTTTCCTGCTTCAAAGAAGCAGCGATCTGAACAAAACTATGGCTCTCTCAATCTCATATCCTGCGCCCACGGCGCACATTAGCTGCTCTGCCTCTTCCCGGAGCTCCACAGTTCCCTCTGCTTCCCTGCTGAAAAATCTCAAGCCCCCTCGTTTCTGGCCATGGCAAAAGGTAAAG...

XM_057942829.1
CAAATTAAAAAAAAGATATAACTATTTTCAGTTGGTGGCGCCTTTGCTCCTTCCATCTCTTATCCATCTTCAAAGACACCTTATTTTTCCTGCTTCAAAGAAGCAGCGATCTGAACAAAACTATGGCTCTCTCAATCTCATATCCTGCGCCCACGGCGCACATTAGCTGCTCTGCCTCTTCCCGGAGCTCCACAGTTCCCTCTGCTTCCCTGCTGAAAAATCTCAAGCCCCCTCGTTTCTGGCCATGGCAAAAGGTAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014746
ATGGCTCTCTCAATCTCATATCCTGCGCCCACGGCGCACATTAGCTGCTCTGCCTCTTCCCGGAGCTCCACAGTTCCCTCTGCTTCCCTGCTGAAAAATCTCAAGCCCCCTCGTTTCTGGCCATGGCAAAAGGTAAAGGTAGGATCTCTGAGTGTATCTCCAATGGGGTTTGGAACGTGGGCTTGGGGCAATCAGCTTTTGTGGGGTTATGAAGAATCCATGGACGCTGAGCTTCAGCAGGTTTTCAATCTTGCCGTCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798811.1
MALSISYPAPTAHISCSASSRSSTVPSASLLKNLKPPRFWPWQKVKVGSLSVSPMGFGTWAWGNQLLWGYEESMDAELQQVFNLAVENGINLFDTADSYGTGRLNGQSEKLLGKFIRDFPGNKQVRDKIVIATKFAAYPWRLTPNQFVGACRSSLDRLQVDQIGIGQLHWSTANYAPLQEGALWDGLVAMYDKGLVGAVGVSNYGPKQLLKIYNYLEARGVPLVSAQVQFSLLSMGEDQIEMKRICDSLGIRVIAYSPLG...

XP_057798812.1
MALSISYPAPTAHISCSASSRSSTVPSASLLKNLKPPRFWPWQKVKVGSLSVSPMGFGTWAWGNQLLWGYEESMDAELQQVFNLAVENGINLFDTADSYGTGRLNGQSEKLLGKFIRDFPGNKQVRDKIVIATKFAAYPWRLTPNQFVGACRSSLDRLQVDQIGIGQLHWSTANYAPLQEGALWDGLVAMYDKGLVGAVGVSNYGPKQLLKIYNYLEARGVPLVSAQVQFSLLSMGEDQIEMKRICDSLGIRVIAYSPLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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