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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003892`

染色体: Chr03 坐标: 58012866-58013804 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003892`
名称	SmilChr03G003892
描述	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58012866 - 58013804 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014750`
GeneID	`131014750`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014750`
原始查询	`SmilChr03G003892`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1-like
产物	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1-like
Arabidopsis	`AT4G35800` (NRPB1) RNA polymerase II large subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829734] identity=86.2; qcov=0.758; evalue=3.04e-68; confidence=high
Rice	`Os05g0151000` - identity=85.8; qcov=0.739; evalue=1.91e-65; confidence=high
GO	GO:0001055 (GO:0001055); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005665 (RNA polymerase II, core complex); GO:0006351 (DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04997 (RNA_pol_Rpb1_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014750

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798818.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057798818.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057798818.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798818.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798818.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58013100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr3:58013103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C74
`Chr3:58013106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:58013124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B9,C62
`Chr3:58013136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B26
`Chr3:58013149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B125
`Chr3:58013299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,B72
`Chr3:58013330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B118,C11,C75
`Chr3:58013428`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A16
`Chr3:58013428`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A16
`Chr3:58013447`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A16
`Chr3:58013447`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798818.1

153 aa

153

RNA_pol_Rpb1_1

PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 14-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798818.1`	Pfam	`PF04997`	RNA_pol_Rpb1_1	Domain	14	116	1.8e-40	140.0	RNA polymerase Rpb1, domain 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942835.1
CCCATCTTCTTCATTGGTCTCAAAACCGCCACCTTCTGAGACGAGCGCAGCGCGAAATAAGTTTCTTTCAAATCCCAAAAAATTAATTACTCAACAGAAATCAACAATAATTTGAAGTACTGAAAAACCATATTTTGTTTTTAATTTTGAAATTATTAGTAGCATCATAGATCATAATCGAAAACCTAGGGAACAATTTCCGGTGTCGCAATGGATCTGCGGTTCCCCTTCTCGCCGGCAGAGGTTGCGAAGGTCTGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014750
ATGGATCTGCGGTTCCCCTTCTCGCCGGCAGAGGTTGCGAAGGTCTGCGTCGTCCAATTCGGCATACTCAGCCCCGATGAGATCAGACAAATGTCAGTTGTGCATATAGAGCACAGCGAGACGACGGAAAGAGGCAAGCCGAAGATCGGTGGTTTGAGCGACCCGCGTCTGGGGACGATTGATCGGAAGATGAAGTGCGAGACTTGTATGGCGAACATGGCTGATTGCCCCGGCCACTTCGGTCACCTTGAGCTCGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798818.1
MDLRFPFSPAEVAKVCVVQFGILSPDEIRQMSVVHIEHSETTERGKPKIGGLSDPRLGTIDRKMKCETCMANMADCPGHFGHLELAKPMFHIGFMKTVLSILRSVCFNCSKILTDEVLYVSRVFRLKFMDAFGLISMNLYSHLHLIDIGYSLY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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