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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003896`

染色体: Chr03 坐标: 58057346-58057959 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003896`
名称	SmilChr03G003896
描述	protein LE25-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58057346 - 58057959 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014754`
GeneID	`131014754`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014754`
原始查询	`SmilChr03G003896`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LE25-like
产物	protein LE25-like
Arabidopsis	`AT5G06760` (LEA4-5) Late Embryosis Abundant 4-5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830565] identity=62.1; qcov=0.564; evalue=4.68e-22; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0009793 (embryo development ending in seed dormancy)
KEGG	-
Pfam	PF03760 (LEA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014754

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798823.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057798823.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057798823.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798823.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798823.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58057445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:58057467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B76
`Chr3:58057476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B140
`Chr3:58057585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:58057707`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A14,C13
`Chr3:58057707`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A14,C13
`Chr3:58057739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:58057754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B47,B50,B60
`Chr3:58057762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr3:58057826`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A13,A18,A3,B109,B133,B134,B34,B52,C61
`Chr3:58057838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C54,C76
`Chr3:58057842`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A14,B40,B48,B75,B78,B85,B90,B92,C13,C38,C49,C78,D3,D4,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798823.1

117 aa

117

LEA_1

PF03760 LEA_1 3-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798823.1`	Pfam	`PF03760`	LEA_1	Domain	3	74	8.4e-21	75.0	Late embryogenesis abundant (LEA) group 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942840.1
GCCTTCTCTTCCCAACTGTAGAGAGATCAAGCTAAAGATTTTAATTCCATCAAAAAGCAAACGACGCAGAAAAAATGCAGTCTGCTAAGGACATCGCGGCTTCGGCCAAGGCTGGCATGGAGAAAACCAAGGCCACGCTCCAAGAAAAGGGTGAGAGAATGACGGCGCGGGACCCGTTGCAGAAGGAGATGGCGACGGAGAAGAAAGAGGCGAAGATCCACGAGGCGGAGCGCCGGAAGCACGAAGCGCGTCATCACAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014754
ATGCAGTCTGCTAAGGACATCGCGGCTTCGGCCAAGGCTGGCATGGAGAAAACCAAGGCCACGCTCCAAGAAAAGGGTGAGAGAATGACGGCGCGGGACCCGTTGCAGAAGGAGATGGCGACGGAGAAGAAAGAGGCGAAGATCCACGAGGCGGAGCGCCGGAAGCACGAAGCGCGTCATCACAACGCCGCCGCTGCTGAAGTCGCTCATACCACCGGGACCGGGGTGTTCGGTGGCCACCCGACTGGGGCGGAATACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798823.1
MQSAKDIAASAKAGMEKTKATLQEKGERMTARDPLQKEMATEKKEAKIHEAERRKHEARHHNAAAAEVAHTTGTGVFGGHPTGAEYTAEGMGGGVGHHGTHTGGVGHHGTHTGGGTY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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