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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003899`

染色体: Chr03 坐标: 58086218-58089325 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003899`
名称	SmilChr03G003899
描述	uncharacterized SmilChr03G003899
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58086218 - 58089325 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014755`
GeneID	`131014755`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014755`
原始查询	`SmilChr03G003899`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817408]; symbol=AT2G28600; hit=AT2G28600; species=arabidopsis; confidence=high
产物	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817408]; symbol=AT2G28600; hit=AT2G28600; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G28600` (AT2G28600) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817408] identity=50.2; qcov=0.712; evalue=1.08e-59; confidence=high
Rice	`Os12g0147500` - identity=48.7; qcov=0.677; evalue=7.72e-52; confidence=high
GO	GO:0000932 (P-body); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0010494 (cytoplasmic stress granule); GO:0033962 (P-body assembly); GO:0034063 (stress granule assembly)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014755

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798824.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798824.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798824.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798824.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798824.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58087908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:58087963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:58088307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C44
`Chr3:58088406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:58088556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798824.1

288 aa

144

288

DEAD

PF00270 DEAD 166-274 aa

XP_057798825.1

288 aa

144

288

DEAD

PF00270 DEAD 166-274 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798824.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	166	274	7.6e-07	29.7	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057798825.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	166	274	7.6e-07	29.7	DEAD/DEAH box helicase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942841.1
TCATAACACGAACTCCTCTTTTACCACTCTTCACTCTTGAAACCGCCTTCATCAACCGCTCTGCTTCAGCTATTCTCCGCCATCAATGGCCAAAACTATCAAATTTTAAGTCCAATAACCGAATTCCTCATCGGAGGCCGCTTCCAGTATACCCGCCGAGAGCCGCACCCAATCCAATCACCGTCGTCTCTGTCAGGTGATTGATACAAAGAGGAAGATAAGTTCTACAGAAAGTATGAATACGGTGGAAACCAAAGTTG...

XM_057942842.1
ACTCCTCTTTTACCACTCTTCACTCTTGAAACCGCCTTCATCAACCGCTCTGCTTCAGCTATTCTCCGCCATCAATGGCCAAAACTATCAAATTTTAAGTCCAATAACCGAATTCCTCATCGGAGGCCGCTTCCAGTATACCCGCCGAGAGCCGCACCCAATCCAATCACCGTCGTCTCTGTCAGGTGATTGATACAAAGAGGAAGATAAGTTCTACAGAAAGTATGAATACGGTGGAAACCAAAGTTGGTAGTTTATGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014755
ATGAATACGGTGGAAACCAAAGTTGGTAGTTTATGGAAGGGCTGTCACAACGACAATGCTGTGCGTTCAGGTAGTCGAAAAAAGGAGAGTATGGAGCCTGAGAATTTGGAGAATGGAATGGCAGAATTGGTTAGGTCTGTTGGTATCATTGGACAAGAGATTGCAATTGATGTAGGGAAGCCAACATGGCGGATTATCAGATGGGACGACTCCAATCATTCTTGGGAAGAACTTGATGCTGACAGCGATGATGGATGCCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798824.1
MNTVETKVGSLWKGCHNDNAVRSGSRKKESMEPENLENGMAELVRSVGIIGQEIAIDVGKPTWRIIRWDDSNHSWEELDADSDDGCPSKFLIQCLNSIQNALELSPEEGRPFFTNSWGYEFWSCYNNGNDVLDTDGVYSKIEKIAWITSTATDSISMKEKEGVSLNCPFLLYLVPSQDIACKVLEVCKPLEALGVCTLFLHSGISIDLQIQSLKTSEPEFIISTPERLLELLSLKAVNVSDLSLMVIDGLEVPFGGTYLD...

XP_057798825.1
MNTVETKVGSLWKGCHNDNAVRSGSRKKESMEPENLENGMAELVRSVGIIGQEIAIDVGKPTWRIIRWDDSNHSWEELDADSDDGCPSKFLIQCLNSIQNALELSPEEGRPFFTNSWGYEFWSCYNNGNDVLDTDGVYSKIEKIAWITSTATDSISMKEKEGVSLNCPFLLYLVPSQDIACKVLEVCKPLEALGVCTLFLHSGISIDLQIQSLKTSEPEFIISTPERLLELLSLKAVNVSDLSLMVIDGLEVPFGGTYLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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