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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003900`

染色体: Chr03 坐标: 58108793-58111741 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003900`
名称	SmilChr03G003900
描述	GABA transporter 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58108793 - 58111741 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014757`
GeneID	`131014757`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014757`
原始查询	`SmilChr03G003900`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GABA transporter 1-like
产物	GABA transporter 1-like
Arabidopsis	`AT1G08230` (AT1G08230) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837344] identity=57.9; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0857400` (OsGAT3) - identity=60.4; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014757

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798827.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798827.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798827.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798827.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798827.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58109440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr3:58109464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C7,C71
`Chr3:58109560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:58109569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:58110022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C7,C71
`Chr3:58110818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:58110857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:58111010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr3:58111327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:58111336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr3:58111339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,D2
`Chr3:58111522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798827.1

454 aa

227

454

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 34-440 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798827.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	34	440	1.3e-59	202.6	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942844.1
TCTTGAAGTATTGCACCGTCGAAAAAATCTGAGTGTCACTGTTTATAATGTACTTCCCCATTTCTCCGTTGACCATGAATATCTATCAATAACGTAACGCACTTAAAATTCCCTCCACACACACCCCCTTAGAGAGAGAGAGAGAATGGGAACTCTTGCAGTGGATTCCACCGGAAGATTCCCTGAAGGTGGTGAAAATGATTCTAGGAATCTCGACGCCGGCGCCCTCTTTGTCCTTAAATCTCGAGGTTCATGGCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014757
ATGGGAACTCTTGCAGTGGATTCCACCGGAAGATTCCCTGAAGGTGGTGAAAATGATTCTAGGAATCTCGACGCCGGCGCCCTCTTTGTCCTTAAATCTCGAGGTTCATGGCTGCATTGCGGTTGCCATCTAACGATGGCTATAGTTTCGCCTGTGCTGCTGAGCTTGCCCTTCGCCTTCACCTTATTGGGGTGGAGCGGCGGCCTTCTTTGCCTCACGGCTGCCGGACTCATCACGTTTTACTCCTATAGCCTTCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798827.1
MGTLAVDSTGRFPEGGENDSRNLDAGALFVLKSRGSWLHCGCHLTMAIVSPVLLSLPFAFTLLGWSGGLLCLTAAGLITFYSYSLLSIVLEHFAQLGRRHLRFRDMAHDILGPAWGRYFVGPLQLGICYFAVIACTLLGGQSLKYIYLLSRPNGSMQLHQFIAIFGGLTLIMAQMPSFHSLRHINLVSLFLCLAYCACTTAGAVYIGHSHKASKTDYTVSGKSINLVFGIFNAISIISTAYGNGIIPEIQATIAPPVTGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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