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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003902`

染色体: Chr03 坐标: 58122470-58125884 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003902`
名称	SmilChr03G003902
描述	uncharacterized SmilChr03G003902
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58122470 - 58125884 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014758`
GeneID	`131014758`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014758`
原始查询	`SmilChr03G003902`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	type-1 restriction enzyme mjaxp r protein (DUF668) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830334]; symbol=AT5G04550; hit=AT5G04550; species=arabidopsis; confidence=high
产物	type-1 restriction enzyme mjaxp r protein (DUF668) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830334]; symbol=AT5G04550; hit=AT5G04550; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G04550` (AT5G04550) type-1 restriction enzyme mjaxp r protein (DUF668) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830334] identity=51.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0146500` - identity=45.2; qcov=0.439; evalue=4.29e-58; confidence=low
GO	GO:0045927 (positive regulation of growth)
KEGG	-
Pfam	PF05003 (DUF668); PF11961 (DUF3475)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014758

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798828.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057798828.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798828.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798828.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798828.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58123647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr3:58123661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B107,B54,C63,C79
`Chr3:58123802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,C56
`Chr3:58123889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,C56
`Chr3:58123984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:58124090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B25,B35
`Chr3:58124187`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C45
`Chr3:58124187`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C45
`Chr3:58124198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr3:58124363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:58124495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B48,B64
`Chr3:58124551`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798828.1

590 aa

295

590

DUF3475

DUF668

PF11961 DUF3475 28-84 aa PF05003 DUF668 427-518 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798828.1`	Pfam	`PF11961`	DUF3475	Family	28	84	1.3e-22	80.3	Domain of unknown function (DUF3475)
`XP_057798828.1`	Pfam	`PF05003`	DUF668	Family	427	518	2.6e-35	121.4	Protein of unknown function (DUF668)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942845.1
CAACTTTCTACAATTTCGGCTTCTTTCCTGCATGTGCCCTTCTCTCTCTGTCTCCTCTCTCTCTCACCTGCTTGCTGCTCTCCACTCTCCCACCTTTCCCTTCTCTTTCCATTTCCTTTTCCTCTTCTTTAACCACAGCCTCGTTAATTGTGTTGATTCTGGTAGATTCAATTTTGTGGTATCTGTTTTCTCACCTCCAAGGGCAATTATACCTTTTACTTCGAAATCAAGAAACGGTCAATAGGATTTGGTGAGAAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014758
ATGGTCACCCAATCATGGTTCCGTAGTCTGTGGACACCATCGAAGAAGAATGAGTTTCATACTGAAAAGGCAAAGATTGCGGTTTTGGCCTTTGAGGCTGCTAGCTTGATGACTAAACTGCTTCACCTGTGGCAATCAATGACTGATAAGCAGGTTGCTAGGTTAAGAGAGGAGATAAATAGCTCGTTGGGTATAAAGAAGCTTGTATCGGAGAGTGATGATTATATTGGGAGGTTGATTTGTGCGGAGATGATGGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798828.1
MVTQSWFRSLWTPSKKNEFHTEKAKIAVLAFEAASLMTKLLHLWQSMTDKQVARLREEINSSLGIKKLVSESDDYIGRLICAEMMENLVHVARALARLSKKCNDPLLRSFEQAFNDLIKGGADPYGWQFSWKKMERKVKKMERFIVANANLYQEMETLADLEQALKRMKGNDSTDSITLVEYEKKIAWKRQEVKHLKENSLWSRTYDYTILLMARSLFTTYGRIGHVFGVNQIADMGVNSRVIDVSNNRRSHSTVFMQSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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