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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003906`

染色体: Chr03 坐标: 58158202-58162638 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003906`
名称	SmilChr03G003906
描述	pyruvate kinase 2, cytosolic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58158202 - 58162638 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014762`
GeneID	`131014762`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014762`
原始查询	`SmilChr03G003906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pyruvate kinase 2, cytosolic-like
产物	pyruvate kinase 2%2C cytosolic-like
Arabidopsis	`AT3G52990` (AT3G52990) Pyruvate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824465] identity=84.4; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0145700` - identity=83.8; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004743 (pyruvate kinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0030955 (potassium ion binding)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00224 (PK); PF02887 (PK_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014762

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798832.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798832.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798832.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798832.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798832.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58159351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A20,A3,B109,B111,B118,B120,B122,B123,B125,B128,B134,B137,B14,B18,B35,B44,B5,B67,B7,B95,C1,C11,C13,C43,C47,C53,C59,C66,C69,C7,C83,C84,D8
`Chr3:58159401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr3:58159409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr3:58159435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B110,B4,C25,C5
`Chr3:58159721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D2
`Chr3:58160183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:58160207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:58160268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,C11,C39,C69
`Chr3:58160596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B37,B63,B89
`Chr3:58160921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B48,B75,C26,C72
`Chr3:58161003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr3:58161270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798832.1

528 aa

264

528

PK_C

PF00224 PK 31-361 aa PF02887 PK_C 396-516 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798832.1`	Pfam	`PF00224`	PK	Domain	31	361	7.8e-87	292.1	Pyruvate kinase, barrel domain
`XP_057798832.1`	Pfam	`PF02887`	PK_C	Domain	396	516	1.9e-23	83.5	Pyruvate kinase, alpha/beta domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942849.1
TGATTGAGACAGCGACAGCACATTGATTTTTTACGTAGAAATATGGCAAAATGTCCCGTTTTCCCTTCACTCCTCCATCATTGGTGTCATCGCACCTAACCTAACTCGATTTATCATCGTATCGTCGGACAGAGGAAAGAACTCACTCTCCACTGTGTGTTTGTGCGTGAAAAATGGTGGTCTCAAATTACCTGCTTCTTGAAGAGCCCCTGAGGATGGCTTCCATCCTCGAGCCATCCAAGCCTAGTTTCTTTCCGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014762
ATGGTGGTCTCAAATTACCTGCTTCTTGAAGAGCCCCTGAGGATGGCTTCCATCCTCGAGCCATCCAAGCCTAGTTTCTTTCCGGCAATGACGAAGATAGTGGGGACACTAGGCCCAAATTCGCGGTCCGTCGAGGTTATATCTGGCTGTCTCAAGGCTGGAATGTCTGTTGCACGATTTGATTTCTCATTTGGTGATGCAAAATTTCACCAAGAAACATTGGAGAACTTATCGATGGCAGTCAAGGCGACCAAAAAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798832.1
MVVSNYLLLEEPLRMASILEPSKPSFFPAMTKIVGTLGPNSRSVEVISGCLKAGMSVARFDFSFGDAKFHQETLENLSMAVKATKKLCGVMLDTLGPELLLVNKSEHPIALKEDSLVVLTPNQDKQASSDLLPINFSGLSKAVKKGDDIFIGQYLFTGNETTSVWLEVSEVKGEDVVCLIKNSATLAGPLYTLHASGIRIDLPTLTDKDKEVISTWGVQNKIDFLSLSYARRAEDVRHAREFLSGLADLSQTQIFAKIEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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