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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003913`

染色体: Chr03 坐标: 58222703-58223794 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003913`
名称	SmilChr03G003913
描述	uncharacterized SmilChr03G003913
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58222703 - 58223794 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019060`
GeneID	`131019060`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019060`
原始查询	`SmilChr03G003913`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=23.4; qcov=0.931; evalue=9.03e-11; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=27.5; qcov=0.76; evalue=6.22e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019060

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803724.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803724.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057803724.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057803724.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803724.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58222705`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	63	A19,A6,A8,B111,B112,B117,B119,B129,B132,B135,B137,B14,B15,B20,B22,B25,B27,B34,B36,B37,B41,B47,B49,B51,B54,B57,B62,B65,B68,B74,B77,B8,B82,B84,B86,B97,B99,C10,C12,C14,C17,C18,C19,C2,C26,C37,C38,C39,C42,C44,C46,C51,C55,C60,C71,C77,C80,C82,C84,C87,C9,D1,D9
`Chr3:58222711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A2,B110,B4,C25,C5,D5
`Chr3:58222717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A24,B1,B103,B109,B114,B121,B127,B128,B23,B38,B39,B4,B47,B5,B50,B53,B62,B7,B70,B78,B87,B89,B94,C1,C14,C24,C28,C31,C4,C46,C5,C53,C61,C65,C77,D6
`Chr3:58222746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A10,A14,A21,B1,B100,B101,B12,B139,B2,B35,B49,B56,B6,B65,B79,B9,B96,C11,C27,C39,C45,C50,C58,C67,C69,C72,C85,D2
`Chr3:58222809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B84,C24
`Chr3:58222856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B41,B48,B75,C78
`Chr3:58222857`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	125	A1,A11,A13,A19,A22,A24,A25,A4,A5,A7,A8,A9,B10,B102,B103,B104,B105,B106,B108,B11,B113,B115,B118,B120,B121,B125,B127,B128,B130,B131,B134,B138,B139,B16,B17,B19,B21,B23,B25,B27,B28,B29,B30,B31,B32,B34,B36,B38,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B5,B53,B55,B57,B59,B60,B64,B67,B68,B69,B72,B73,B74,B76,B8,B80,B83,B85,B90,B92,B95,B97,C15,C16,C20,C21,C22,C23,C27,C28,C29,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C49,C51,C52,C54,C56,C57,C59,C6,C65,C68,C69,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C81,C83,C84,C86,C87,D10,D4,D5,D6,D7
`Chr3:58222874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,A22
`Chr3:58222882`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B127,B62,C14,D6
`Chr3:58222882`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B127,B62,C14,D6
`Chr3:58222883`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B127,B62,C14,D6
`Chr3:58222883`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B127,B62,C14,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803724.1

363 aa

182

363

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 165-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803724.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	165	259	4.2e-16	60.1	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947741.1
ATGAAATGGATATGGAGATATTGGGAAGAGAGAGAGTTGTTGTGGGCAAAAGTCGTGAGATCATTATATGGAGACGTTGAGTGTGGAGAGGAGGGCCTTCACCTCAGGGGTACTAGAAGAAATAAGGGTGGATGGTGGCCGAAAGTCTTGTCAGTGGGGGGAACAACATCTGGGAAATGGTTCCTGGACAATATCTGTCGAAAGATTGGGAACGGGAATGAGACCAAGTTCTGGGAGCACAAATGGGTAGGGACAAAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019060
ATGAAATGGATATGGAGATATTGGGAAGAGAGAGAGTTGTTGTGGGCAAAAGTCGTGAGATCATTATATGGAGACGTTGAGTGTGGAGAGGAGGGCCTTCACCTCAGGGGTACTAGAAGAAATAAGGGTGGATGGTGGCCGAAAGTCTTGTCAGTGGGGGGAACAACATCTGGGAAATGGTTCCTGGACAATATCTGTCGAAAGATTGGGAACGGGAATGAGACCAAGTTCTGGGAGCACAAATGGGTAGGGACAAAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803724.1
MKWIWRYWEERELLWAKVVRSLYGDVECGEEGLHLRGTRRNKGGWWPKVLSVGGTTSGKWFLDNICRKIGNGNETKFWEHKWVGTKPLKYVFPRLFQLSANKDVTVGEWGTWEEGSWIWEMKWMRDLFERENEAIEQLKNSISHYVPVPGRVDSWVWEVSPDGKFSTKSAYLTIKASRIMESRTNGEEKRRATIWKSPAPQKAIVTAWRLMRNRLPTCDNLRKRSIDFGKEESKCNEYKLLPESTNHLFLTCPKTEEVWN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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