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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003917`

染色体: Chr03 坐标: 58256570-58257550 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003917`
名称	SmilChr03G003917
描述	uncharacterized SmilChr03G003917
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58256570 - 58257550 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014775`
GeneID	`131014775`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014775`
原始查询	`SmilChr03G003917`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TLDc domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840146]; symbol=AT1G32520; hit=AT1G32520; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TLDc domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840146]; symbol=AT1G32520; hit=AT1G32520; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G32520` (AT1G32520) TLDc domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840146] identity=69.4; qcov=1.04; evalue=2.82e-114; confidence=high
Rice	`Os11g0220300` - identity=66.2; qcov=0.612; evalue=8.31e-55; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07534 (TLD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014775

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798846.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057798846.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798846.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798846.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798846.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58256748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:58256753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:58256794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr3:58256816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:58256822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B24,B98,C36,C48
`Chr3:58256824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,C38,C52,C76
`Chr3:58256825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C87
`Chr3:58256846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B85
`Chr3:58256947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B9,C27
`Chr3:58256953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B111,B51,B68,C71
`Chr3:58256958`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A18,A19,A2,A6,A8,B101,B103,B11,B122,B126,B27,B33,B36,B41,B46,B77,B8,B84,B99,C10,C12,C26,C33,C36,C37,C39,C44,C51,C64,C66,C82,C87,D8,D9
`Chr3:58256985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798846.1

232 aa

116

232

TLD

PF07534 TLD 56-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798846.1`	Pfam	`PF07534`	TLD	Domain	56	123	2.8e-11	44.3	TLDc domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942863.1
CCATCAACCAGAAATCCATTGATAATGGATATAGGAAGAACACAAATGAGAGAGAAGATCTATTTTTTTTGTATGATTGGATCTTCATTAGAAGAAGAAGATAGATGAAGTGTTTGTGTGTGTCAAATTCTGCATTAATATCGCCTAGGAAGAAGGCATGCCCACAGAGCTTCTTCAACTGGGATTTTGGCAGAAGCAAAAAACCAGAGCCCATCTACTATCAAGATATTGACCTCCCATTCTCTCCTTCTCTTTTATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014775
ATGAAGTGTTTGTGTGTGTCAAATTCTGCATTAATATCGCCTAGGAAGAAGGCATGCCCACAGAGCTTCTTCAACTGGGATTTTGGCAGAAGCAAAAAACCAGAGCCCATCTACTATCAAGATATTGACCTCCCATTCTCTCCTTCTCTTTTATCCAAAACATTCTTGAAAGGTAGGGAGCTGAAATGCTGCTACAAGGCAAAAACAGATGGATTCAGCGCAACCGAATTCCACAACAAATGCGACTTTAAAGGGCCATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798846.1
MKCLCVSNSALISPRKKACPQSFFNWDFGRSKKPEPIYYQDIDLPFSPSLLSKTFLKGRELKCCYKAKTDGFSATEFHNKCDFKGPCVIIGYTTSNFKFGAFNPEGYRSTDDYYDSFDAFLFYWPDDDDDGAAPVVLPKVGGSGAALFDYARGGPQFGADGLLIGPPLAPVMGGFAGPDTNSGVGDLRQARSRLGLSYAKRADGKESLFGDESRVTLDQVLVFCSPQIASLY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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