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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003918`

染色体: Chr03 坐标: 58258492-58262037 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003918`
名称	SmilChr03G003918
描述	uncharacterized SmilChr03G003918
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58258492 - 58262037 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014776`
GeneID	`131014776`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014776`
原始查询	`SmilChr03G003918`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824382]; symbol=AT3G52170; hit=AT3G52170; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824382]; symbol=AT3G52170; hit=AT3G52170; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G52170` (AT3G52170) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824382] identity=30.3; qcov=1.15; evalue=5.8e-46; confidence=low
Rice	`Os12g0528000` - identity=71.9; qcov=0.139; evalue=6.04e-25; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25896 (HTH_AT3G52170)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014776

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057798847.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057798847.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057798847.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057798847.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057798847.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58259567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B10,B74,D4
`Chr3:58259584`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B111,B51
`Chr3:58259584`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B111,B51
`Chr3:58260427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B10,B74,D4
`Chr3:58260442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:58260538`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	140	A1,A11,A18,A19,A2,A20,A23,A24,A3,A6,A7,A8,B10,B102,B104,B11,B110,B112,B113,B115,B119,B122,B128,B13,B130,B131,B132,B134,B137,B138,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B24,B27,B29,B31,B33,B35,B36,B37,B4,B40,B41,B42,B43,B46,B52,B55,B59,B6,B62,B63,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B76,B77,B8,B83,B84,B85,B89,B9,B95,B97,B98,B99,C10,C12,C14,C15,C16,C17,C21,C22,C25,C26,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C61,C64,C65,C66,C68,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C85,C86,C87,C9,D10,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr3:58260540`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	140	A1,A11,A18,A19,A20,A23,A24,A3,A6,A7,A8,B10,B102,B104,B11,B110,B112,B113,B115,B118,B119,B122,B128,B13,B130,B131,B132,B134,B137,B138,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B24,B27,B29,B31,B33,B35,B36,B37,B4,B40,B41,B42,B43,B46,B52,B55,B59,B6,B62,B63,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B76,B77,B8,B83,B84,B85,B89,B9,B95,B97,B98,B99,C10,C12,C14,C15,C16,C17,C21,C22,C25,C26,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C61,C64,C65,C66,C68,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C85,C86,C87,C9,D10,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr3:58260629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	56	A1,A10,A11,A15,A16,A2,A7,B103,B106,B111,B115,B119,B122,B129,B13,B130,B131,B136,B139,B140,B18,B2,B47,B49,B55,B56,B63,B67,B77,B80,B83,B86,B89,B91,B96,C1,C27,C30,C35,C36,C37,C39,C41,C47,C48,C59,C61,C65,C71,C75,C76,C81,C83,D10,D5,D8
`Chr3:58260724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B127,B131,B134,B34
`Chr3:58260748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:58260752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:58260914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B111,B51,B68,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798847.1

462 aa

231

462

HTH_AT3G52170

PF25896 HTH_AT3G52170 31-79 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798847.1`	Pfam	`PF25896`	HTH_AT3G52170	Domain	31	79	4.2e-23	81.3	Helix-turn-helix domain in AT3G52170-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942864.1
ATTAATTAATATCAAAATTTGGAAAATTTTGCATTGGGCCACTTTTCTGTGAAACAGTTGGTAGGGTTTATTATTTTCACACTCACTCTACTCTACTCTCCCCCCATTTTCCAAAATCCAGCTCCCTCACTTTAATCTACTCCTCCCCAGATTCTGCTCTCTGGCTTTGCTGTTGATATCTAAGTCATGCAAGCTGGCAAGGTTGGCTGGGCTGGGCAAGCATTTGCACTTGCCTCCAGCAATGACTCAGGTGGGAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014776
ATGCAAGCTGGCAAGGTTGGCTGGGCTGGGCAAGCATTTGCACTTGCCTCCAGCAATGACTCAGGTGGGAAGAAGACACGAGTTAGACGGTCAAAAGAGGAGAGGAAATCGATAGCTGAGTCATTCATAAAGAAATATCAGAATTCGAATGATGGAAATTTCCCATCCCTCAACCTTACACACAAAGAAGTTGGTGGTTCTTTCTATACAGTCAGGGAGATTGTTCGAGAGATTATTCAAGAAAATCGAGTCTTAGCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798847.1
MQAGKVGWAGQAFALASSNDSGGKKTRVRRSKEERKSIAESFIKKYQNSNDGNFPSLNLTHKEVGGSFYTVREIVREIIQENRVLAPPKVSPEENGLSGFLEQHPLGSISMEPIIDRGDAVTHVEAQRNSIFKCRQCSTSSESYELADKDGGSNRTSESHHLPNHYHDESMEEVSNSPQMKSHKFEENIVNGFVVADHHKDIDEGRRGQMLNNEQYHVKNNQTVDKDKEFGERIYTEPTAIKTLNQEKLEAHNVELSRPF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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