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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003922`

染色体: Chr03 坐标: 58308734-58309500 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003922`
名称	SmilChr03G003922
描述	histone H2B.3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58308734 - 58309500 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014779`
GeneID	`131014779`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014779`
原始查询	`SmilChr03G003922`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone H2B.3-like
产物	histone H2B.3-like
Arabidopsis	`AT3G45980` (HTB9) Histone superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823741] identity=85.5; qcov=1.07; evalue=1.12e-78; confidence=high
Rice	`Os03g0279000` (H2B1) - identity=81.3; qcov=0.944; evalue=4.78e-67; confidence=high
GO	GO:0000786 (nucleosome); GO:0003677 (DNA binding); GO:0006334 (nucleosome assembly); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00125 (Histone); PF00808 (CBFD_NFYB_HMF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014779

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798850.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057798850.1`
3	Chromatin	染色质	0.40000	`XP_057798850.1`
4	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057798850.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057798850.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58309014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B78
`Chr3:58309056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:58309065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:58309107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C11,C69
`Chr3:58309226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:58309259`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B2,B56,B6,B96,C67
`Chr3:58309259`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B2,B56,B6,B96,C67
`Chr3:58309262`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B2,B56,B6,B96,C67
`Chr3:58309262`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B2,B56,B6,B96,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798850.1

142 aa

142

Histone

CBFD_NFYB_HMF

PF00125 Histone 38-118 aa PF00808 CBFD_NFYB_HMF 60-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798850.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	38	118	9.7e-21	74.7	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain
`XP_057798850.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	60	116	0.00027	21.9	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942867.1
CCGCCAATTTCCAGATCAATCTAAACGGCTGAGAATATCAATCCGCGACAACTGAATTCCACCAATCACATCTCGCCGCTCGTTTCCTATATAAACAAACCCTACTATACAATAATTCTCATCATCTCAACATTCACGCAAATTTCCATCGAATACAATACAACCCCTATTTTCTCTCTCTAGCTTTATCTCTCTTAAAATGGCGCCTAAGGCCGAGAAGAAGCCTGCCGCCGAGAAGGCCCCCGCGGCTGAGAAGGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014779
ATGGCGCCTAAGGCCGAGAAGAAGCCTGCCGCCGAGAAGGCCCCCGCGGCTGAGAAGGCTCCGGCGGAGAAGAAGCCGAAGGCCGGGAAGAAGCTGCCGAAGGACGGCAGCGCCGCCGCCGGAGACAAGAAGAAGAAGCGTAACAAGAAGAGCGTGGAGACCTACAAGATCTACATCTTCAAGGTGCTGAAGCAGGTTCACCCAGACATCGGTATCTCCAGCAAGGCCATGGGGATCATGAACAGCTTCATCAACGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798850.1
MAPKAEKKPAAEKAPAAEKAPAEKKPKAGKKLPKDGSAAAGDKKKKRNKKSVETYKIYIFKVLKQVHPDIGISSKAMGIMNSFINDIFEKLAQESSRLARYNKKPTITSREIQTAVRLVLPGELAKHAVSEGTKAVTKFTSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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