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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003926`

染色体: Chr03 坐标: 58347800-58350150 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003926`
名称	SmilChr03G003926
描述	expansin-B1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58347800 - 58350150 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019064`
GeneID	`131019064`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019064`
原始查询	`SmilChr03G003926`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-B1-like
产物	expansin-B1-like
Arabidopsis	`AT1G65680` (EXPB2) expansin B2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842879] identity=47.8; qcov=0.379; evalue=5.18e-14; confidence=low
Rice	`Os04g0552000` (EXPB15) - identity=47.5; qcov=0.333; evalue=3.47e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019064

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803727.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803727.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057803727.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803727.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803727.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58348140`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B80,C31
`Chr3:58348140`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B80,C31
`Chr3:58348198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:58348227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:58348235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:58348271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B50,B87,B94
`Chr3:58348325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B123,B126,C42
`Chr3:58348334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr3:58348350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C4,C9
`Chr3:58348359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr3:58350054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr3:58350072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803727.1

177 aa

177

Expansin_C

PF01357 Expansin_C 103-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803727.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	103	162	2.5e-11	44.3	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947744.1
ATGACGTGGAATTGCCGGACGATTAATAAAACGACGCCGTTTAGGGACGCTGCGAATCTTGTGTGGTGGTGGGGTAGGGGCGGCGGATCTGGTGCCTTCGCACCCCTTTTCCTTCTCGCCGGCCCCTTCACGCCCTCGTCTCTCACCACCGGCGAGGAATTCTATGGAACCAGCAGACGTTTGGTGCCGGAGGCGGTGGTGAAGGAGGCGGCGGATCTGCAGGGTTGGTGTGGTGGTGGATCTGGTGTGGTGGTGGTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019064
ATGACGTGGAATTGCCGGACGATTAATAAAACGACGCCGTTTAGGGACGCTGCGAATCTTGTGTGGTGGTGGGGTAGGGGCGGCGGATCTGGTGCCTTCGCACCCCTTTTCCTTCTCGCCGGCCCCTTCACGCCCTCGTCTCTCACCACCGGCGAGGAATTCTATGGAACCAGCAGACGTTTGGTGCCGGAGGCGGTGGTGAAGGAGGCGGCGGATCTGCAGGGTTGGTGTGGTGGTGGATCTGGTGTGGTGGTGGTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803727.1
MTWNCRTINKTTPFRDAANLVWWWGRGGGSGAFAPLFLLAGPFTPSSLTTGEEFYGTSRRLVPEAVVKEAADLQGWCGGGSGVVVVKVANRSRAERAATGVAAGGASDLVQRQPSNSDWVSMQRSWGVTWKCDLREWQKGPFSVRITGPENSTSVTAYNVIPYDWSPGKYYYSNVNF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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