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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003933`

染色体: Chr03 坐标: 58393342-58394546 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003933`
名称	SmilChr03G003933
描述	uncharacterized SmilChr03G003933
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58393342 - 58394546 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014789`
GeneID	`131014789`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014789`
原始查询	`SmilChr03G003933`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hyccin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832229]; symbol=AT5G21050; hit=AT5G21050; species=arabidopsis; confidence=high
产物	hyccin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832229]; symbol=AT5G21050; hit=AT5G21050; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G21050` (AT5G21050) hyccin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832229] identity=51.2; qcov=1.04; evalue=3.18e-108; confidence=high
Rice	`Os03g0722000` (OsSTA112) - identity=48.2; qcov=0.962; evalue=8.39e-89; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0046854 (phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process); GO:0072659 (protein localization to plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF09790 (Hyccin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014789

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798861.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057798861.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057798861.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798861.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798861.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58393489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B136,B140,B26
`Chr3:58393495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:58393588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B14
`Chr3:58393618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C53,C56
`Chr3:58393675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:58393726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B14
`Chr3:58393804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:58393825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,A22
`Chr3:58393915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr3:58394002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:58394065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr3:58394269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798861.1

317 aa

158

317

Hyccin

PF09790 Hyccin 43-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798861.1`	Pfam	`PF09790`	Hyccin	Repeat	43	299	2.3e-46	159.1	Hyccin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942878.1
ATTTCATCATTCTCAATCCCTAATTTAGTAGTACTATCTACAAATGAGCAATTAGTTGAGATCCATTTTTCCTCCTAAATATCCTCCCTTTAAAAAACAAAACAAAAAGGAAATAGAGGAGTTGAATTTGAAGCATTTGTTAGGACGCGATGGGTGATTCACCTGAAAAAGGCGGCGGCAAAGGCCGCATCAAATGGGGCGACCCCTTCAGCAAGGGACGCGCGGCCGTGGAGTCTCTGGGGGCCATCCTCCGGTACTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014789
ATGGGTGATTCACCTGAAAAAGGCGGCGGCAAAGGCCGCATCAAATGGGGCGACCCCTTCAGCAAGGGACGCGCGGCCGTGGAGTCTCTGGGGGCCATCCTCCGGTACTTCCCCCCGCACCTGTCGTCGTCGGAGACCCCCGCCACCTCCCTCCTCCAGGACCCCGACGTGGCGACCCAGATCTCCACCCTCCTCCGCCGCCCCGACTCCGGCGCCGTGAACGACAACCTGTGCGCGTGGCTCTACGACACGTTCCACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798861.1
MGDSPEKGGGKGRIKWGDPFSKGRAAVESLGAILRYFPPHLSSSETPATSLLQDPDVATQISTLLRRPDSGAVNDNLCAWLYDTFHSADPSLQLVVLRFLPILAGVYLTRAALNKPLPGFESVLLAIYAHETAARNGQAATVSIPDLGHPSVYHEAKQPPAKNASTELHLAVITPSLEPHGTVRSTRRAKIVGVALELYYSRISLIPVGSKLDFCDFCRMWSGHDPDGRRGRINLPWELMQPILRILGHCLFRPAKNYDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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