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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003939`

染色体: Chr03 坐标: 58467500-58469984 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003939`
名称	SmilChr03G003939
描述	SHUGOSHIN 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58467500 - 58469984 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014792`
GeneID	`131014792`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014792`
原始查询	`SmilChr03G003939`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SHUGOSHIN 2-like
产物	SHUGOSHIN 2-like
Arabidopsis	`AT5G04320` (AT5G04320) Shugoshin C terminus [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830311] identity=55.2; qcov=0.275; evalue=1.82e-24; confidence=weak
Rice	`Os02g0799100` (OsSGO1) - identity=40.8; qcov=0.31; evalue=1.14e-16; confidence=low
GO	GO:0000775 (chromosome, centromeric region); GO:0034090 (maintenance of meiotic sister chromatid cohesion); GO:0045144 (meiotic sister chromatid segregation)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014792

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798864.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057798864.1`
3	Centromere	着丝粒	0.20000	`XP_057798864.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057798864.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798864.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58467738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C28,D9
`Chr3:58467739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B53,D4
`Chr3:58467920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:58468344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C28,D9
`Chr3:58468553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:58468714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:58468739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C32,C68
`Chr3:58468739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:58468987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B31,B33,B68,C24
`Chr3:58468993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C78
`Chr3:58469003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B90,C24
`Chr3:58469004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,A7,B62,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942881.1
TATTGATAAATATTTCCGTGTGAGAGAGAGGGTGGTGCTGGTTGAGCAGTGATGCCGAAGACGCAAGGTTTTCACATTCTCGATGCGCAGAATGCTTCAATAAGCGAAGATAAATCAAAGAACGCAGCAGGGCTGCACCCTCACAATGTTGTTAGGAGGAAGCTTGCAGACATCAGTAACCAGCCACAAAATCGAAGGCTGTTGTTAATTCAAGAGAAATCTCAATCTATTGAGACGACTACTAAAGAGTACATTAACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014792
ATGCCGAAGACGCAAGGTTTTCACATTCTCGATGCGCAGAATGCTTCAATAAGCGAAGATAAATCAAAGAACGCAGCAGGGCTGCACCCTCACAATGTTGTTAGGAGGAAGCTTGCAGACATCAGTAACCAGCCACAAAATCGAAGGCTGTTGTTAATTCAAGAGAAATCTCAATCTATTGAGACGACTACTAAAGAGTACATTAACCAGCTCCAGAAGGAAAATATGGCTCTGGTGAAGATGTTGGCGCAGAAGAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798864.1
MPKTQGFHILDAQNASISEDKSKNAAGLHPHNVVRRKLADISNQPQNRRLLLIQEKSQSIETTTKEYINQLQKENMALVKMLAQKNEIIQHSGIELDRLRVNLLQMHEQNQQLAIANAQILVELNSGKDRLKMLQHELQCKTGLLKARKMNLEGRETTTAFGDAGAELIKSQKDMKSSKEDIDDEKPHETKKNVQPNGVCPSKQAECEDKTENKRPFKPRQSARFNAAEVKRGEDFFETKETIVSVSQSPDNSVREQGST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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