当前解析结果
SmilChr03G003941| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003941 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003941 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003941 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 58479230 - 58479915 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131019069 |
|---|---|
| GeneID | 131019069 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019069 |
| 原始查询 | SmilChr03G003941 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0191000- identity=29.9; qcov=0.657; evalue=1.05e-10; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF08284 (RVP_2); PF13650 (Asp_protease_2); PF13975 (gag-asp_proteas); PF30863 (PRO_PEG10-RTL1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019069 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803732.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057803732.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057803732.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803732.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803732.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057803732.1PF08284
RVP_2 5-109 aa
PF13650
Asp_protease_2 6-89 aa
PF13975
gag-asp_proteas 7-92 aa
PF30863
PRO_PEG10-RTL1 11-109 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057803732.1 |
Pfam | PF08284 |
RVP_2 | Domain | 5 | 109 | 2.9e-25 | 89.4 | Retroviral aspartyl protease |
XP_057803732.1 |
Pfam | PF13650 |
Asp_protease_2 | Domain | 6 | 89 | 9.5e-09 | 36.6 | Aspartyl protease |
XP_057803732.1 |
Pfam | PF13975 |
gag-asp_proteas | Domain | 7 | 92 | 2.4e-09 | 38.3 | gag-polyprotein putative aspartyl protease |
XP_057803732.1 |
Pfam | PF30863 |
PRO_PEG10-RTL1 | Domain | 11 | 109 | 5.7e-12 | 46.8 | PEG10/RTL1 protease domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。