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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003942`

染色体: Chr03 坐标: 58489759-58493552 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003942`
名称	SmilChr03G003942
描述	probable pectate lyase 13
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58489759 - 58493552 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014795`
GeneID	`131014795`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014795`
原始查询	`SmilChr03G003942`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectate lyase 13
产物	probable pectate lyase 13
Arabidopsis	`AT5G04310` (AT5G04310) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830310] identity=58.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0457200` (DEL1) - identity=64.3; qcov=0.791; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0030570 (pectate lyase activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00544 (Pectate_lyase_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014795

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057798866.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057798866.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798866.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798866.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798866.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58490224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:58491010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr3:58491014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:58491044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:58491046`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B104,B35
`Chr3:58491046`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B104,B35
`Chr3:58491120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C40,C50
`Chr3:58491133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:58491266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:58491302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:58491488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B12,B55,B78
`Chr3:58491576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798866.1

492 aa

246

492

Pectate_lyase_4

PF00544 Pectate_lyase_4 156-359 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798866.1`	Pfam	`PF00544`	Pectate_lyase_4	Repeat	156	359	2.6e-26	93.2	Pectate lyase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942883.1
TTGGAGAATTCACCTGCAGTCACACTGACAGTGTCCCTTTGTAAATCCAAACATATGAAATTTTATTAATTATTTTCTTTTACTACTATATGGAGTATTTTCCAGCATCAAACAGTAGTAAATTGTGTCTGTAAAGAAGAGGCTGCACAAGGGAGACTGCAGTAGTGAGAGATTCCCCCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCATTCTCTCTCTCTCTTGGAGCCTCCTCTCCATGCCCAGGATCTCTATTCTGCTTCAATCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014795
ATGGTTGTTCCTCACACCTACATTCTCTTGCTGCTTCTGTGCCTTATCTTCTCTTCCTCTGTTGGAGCAACCACTTTCTTCAATCTCACCCTCTCTCATCAGCACCCCAACCCTGATTTTGTGGCTCTACAAGTCAGAAGGAGAGTGAATGAATCCATATCGAAACGCCGCCAGATTCTTGAAACCCCCTTATTGAGCAAAGCACAGTCACAATGCTTGACCGGAAACCCCATAGACGACTGCTGGCGCTGCGACTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798866.1
MVVPHTYILLLLLCLIFSSSVGATTFFNLTLSHQHPNPDFVALQVRRRVNESISKRRQILETPLLSKAQSQCLTGNPIDDCWRCDSNWGNNRQRLADCAIGFGQGAMGGKGGRFYEVTDSSDHDTVSPTPGTLRYAVIQDEPLWITFKSNMVIKLKHELIVNSYKTIDGRGANVQITGNGCITLQYVSNVIIHNVQVYNCMPSGNTDIRSSPTHVGHRGKSDGDGISIFGSRNIWIDHCTLSHCTDGLVDIIMGSTAITL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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