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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003951`

染色体: Chr03 坐标: 58571824-58575211 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003951`
名称	SmilChr03G003951
描述	uncharacterized SmilChr03G003951
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58571824 - 58575211 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014810`
GeneID	`131014810`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014810`
原始查询	`SmilChr03G003951`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824653]; symbol=AT3G54880; hit=AT3G54880; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824653]; symbol=AT3G54880; hit=AT3G54880; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G54880` (AT3G54880) zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824653] identity=56.2; qcov=0.809; evalue=2.3e-33; confidence=medium
Rice	`Os07g0479600` - identity=61; qcov=0.745; evalue=2.8e-31; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13259 (clamp_Gag1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014810

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798889.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057798889.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798889.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798889.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798889.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58573638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B99
`Chr3:58573695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798889.1

110 aa

110

clamp_Gag1-like

PF13259 clamp_Gag1-like 70-110 aa

XP_057798890.1

110 aa

110

clamp_Gag1-like

PF13259 clamp_Gag1-like 70-110 aa

XP_057798891.1

110 aa

110

clamp_Gag1-like

PF13259 clamp_Gag1-like 70-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798889.1`	Pfam	`PF13259`	clamp_Gag1-like	Domain	70	110	5.3e-17	63.2	Gag1-like, clamp domain
`XP_057798890.1`	Pfam	`PF13259`	clamp_Gag1-like	Domain	70	110	5.3e-17	63.2	Gag1-like, clamp domain
`XP_057798891.1`	Pfam	`PF13259`	clamp_Gag1-like	Domain	70	110	5.3e-17	63.2	Gag1-like, clamp domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942908.1
CAATGGAACCAAATCCACATCGGCGATGAGAGGGAGAGGGAGAGAGAAAGAGGAATAGAATCTAGAAACTGGAGAAACTGTTTACAGGATGCCACCAAACGAAGAAAACGACGCTGCATATTCTTGAGCCCACATTATGCTTCCTTTTTTCTGCCTATATATACACCATTTCCCCCCTCTCAATTCCTTCTTTATATCCCATTTCTGCTTGGCCTCCACTAAACTAAAGTTGAGGCATACAGTTTGCGAAAGGCTGATGG...

XM_057942906.1
AATGGAACCAAATCCACATCGGCGATGAGAGGGAGAGGGAGAGAGAAAGAGGAATAGAATCTAGAAACTGGAGAAACTGTTTACAGGATGCCACCAAACGAAGAAAACGACGCTGCATATTCTTGAGCCCACATTATGCTTCCTTTTTTCTGCCTATATATACACCATTTCCCCCCTCTCAATTCCTTCTTTATATCCCATTTCTGCTTGGCCTCCACTAAACTAAAGATTTTTGTTATGCTGTAAATCAACATTGAAAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131014810
ATGGAAGTTAATGGTAGAACTTCCCATTGCAATGAAAACCAATGTTCGGAACCTTCTACGTCTCGTAATGAACAGAAAAAGGCAGAAGATAACAGACCAGACACTTCTCAATTTGTTAATCATGCTACGATTGAATGGGAGGAGGACAGAAGAAAATGGATTGGAGATATATCTCAGAGGTCTCAAAGAATGCAAAATGATCCAATTATAAGCTGGTCAACAACGTACGAAGACCTGCTCTCGACCAATGACCCTTTCCC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057798889.1
MEVNGRTSHCNENQCSEPSTSRNEQKKAEDNRPDTSQFVNHATIEWEEDRRKWIGDISQRSQRMQNDPIISWSTTYEDLLSTNDPFPNPIPLPEMVDFLVDIWHDEGLFD

XP_057798890.1
MEVNGRTSHCNENQCSEPSTSRNEQKKAEDNRPDTSQFVNHATIEWEEDRRKWIGDISQRSQRMQNDPIISWSTTYEDLLSTNDPFPNPIPLPEMVDFLVDIWHDEGLFD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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