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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003955`

染色体: Chr03 坐标: 58598636-58598989 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003955`
名称	SmilChr03G003955
描述	protein transport protein Sec61 subunit gamma-1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58598636 - 58598989 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014811`
GeneID	`131014811`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014811`
原始查询	`SmilChr03G003955`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein transport protein Sec61 subunit gamma-1-like
产物	protein transport protein Sec61 subunit gamma-1-like
Arabidopsis	`AT4G24920` (AT4G24920) secE/sec61-gamma protein transport protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828594] identity=70.6; qcov=1.05; evalue=1.66e-27; confidence=medium
Rice	`Os02g0178400` - identity=70.6; qcov=1.05; evalue=1.83e-27; confidence=medium
GO	GO:0006605 (protein targeting); GO:0008320 (transmembrane protein transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0031204 (post-translational protein targeting to membrane, translocation); GO:0071261 (Ssh1 translocon complex)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00584 (SecE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014811

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057798892.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057798892.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798892.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798892.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798892.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58598792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B22
`Chr3:58598840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B24,B26
`Chr3:58598869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B35,C23
`Chr3:58598878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:58598883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C18,D8
`Chr3:58598918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B101,B126
`Chr3:58598953`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B111,B63,B95,C38
`Chr3:58598953`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B111,B63,B95,C38
`Chr3:58598965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B17,D9
`Chr3:58598971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:58598973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798892.1

65 aa

SecE

PF00584 SecE 9-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798892.1`	Pfam	`PF00584`	SecE	Family	9	61	6.6e-10	39.5	SecE/Sec61-gamma subunits of protein translocation complex

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942909.1
ATGGATGCTTTAAATTCGGTGAGAGATTTCCCGAGGCGCAGCGTCTGGTTCGTGAAGCGTTGCCAGAAGCCCGATCTCAACGAATTTACTAAGGTGGCCGCTCGAACGGCCGTCGGCATCGTCGTCATGGGTTTCCTTGCTTTCTTCGTCAAGTTGATTTTCATTCCTATCAACAATATTATCGTTGGCGCTGTCTAGTTAAACTTTTTTTTTTGAATTCTTTTTAGAAAGATTGTCACTTAGAGCCTATGTGGGAAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014811
ATGGATGCTTTAAATTCGGTGAGAGATTTCCCGAGGCGCAGCGTCTGGTTCGTGAAGCGTTGCCAGAAGCCCGATCTCAACGAATTTACTAAGGTGGCCGCTCGAACGGCCGTCGGCATCGTCGTCATGGGTTTCCTTGCTTTCTTCGTCAAGTTGATTTTCATTCCTATCAACAATATTATCGTTGGCGCTGTCTAG

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798892.1
MDALNSVRDFPRRSVWFVKRCQKPDLNEFTKVAARTAVGIVVMGFLAFFVKLIFIPINNIIVGAV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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