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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003963`

染色体: Chr03 坐标: 58676717-58685649 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003963`
名称	SmilChr03G003963
描述	vacuolar protein-sorting-associated protein 33 homolog
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58676717 - 58685649 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014819`
GeneID	`131014819`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014819`
原始查询	`SmilChr03G003963`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein-sorting-associated protein 33 homolog
产物	vacuolar protein-sorting-associated protein 33 homolog
Arabidopsis	`AT3G54860` (ATVPS33) Sec1/munc18-like (SM) proteins superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824651] identity=71.4; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0223000` - identity=64; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005773 (vacuole); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0033263 (CORVET complex)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00995 (Sec1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014819

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798899.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057798899.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057798899.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057798899.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057798899.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58677035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C18,D8
`Chr3:58677759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:58678014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C53,C56
`Chr3:58678040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B135,B71,C62
`Chr3:58678043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:58678900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:58679035`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr3:58679035`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr3:58679044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B50,C54
`Chr3:58680310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr3:58680985`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B131,B35,B68
`Chr3:58680985`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B131,B35,B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798899.1

599 aa

300

599

Sec1

PF00995 Sec1 36-591 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798899.1`	Pfam	`PF00995`	Sec1	Family	36	591	9.8e-114	382.3	Sec1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942916.1
GAGAAAAAATAAGTGAACATTTATAATTTACCTGCGAGGCTGCGACATTTTATACAAAATCGAAGTGGCAAAAACTCCGTGAATCAGTCTCTGCAAGAAGAGGGCATAGAGAAAGAAGCAAATTGAGTAACAATGTCTCAGATTCCCAATTTAGAGAATGCCCCCATAAATCTCACTGAGATACGAATACGAGCTCAAACGGAGCTGCTAAATATCCTCAGAGATATAAAGGGAGATAAATGTTTGGTAATTGATCCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014819
ATGTCTCAGATTCCCAATTTAGAGAATGCCCCCATAAATCTCACTGAGATACGAATACGAGCTCAAACGGAGCTGCTAAATATCCTCAGAGATATAAAGGGAGATAAATGTTTGGTAATTGATCCGAAGCTCAGTGGAGCACTGTCACTTCTTGTCCATAGCTCAGAACTAAAGGAAAATGGTGCTGAATTGCGGCATCTAACAGCTGAGCCAGTTCAAACTGAAAGAACCAAAGTGGTCTTCCTCGTTCGAGCTCAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798899.1
MSQIPNLENAPINLTEIRIRAQTELLNILRDIKGDKCLVIDPKLSGALSLLVHSSELKENGAELRHLTAEPVQTERTKVVFLVRAQPDLMRFICSTIHNDTSKGLHREYYLYFVPRRLVSCENVLAEEKVRELLNIGEFPLYMLPLDEDVLSFELDLTEKECLVEGDETAFWNIAKAIHNLEFTCGVIPNVRAKGKGAARVADILTRMQTEEPVNAANMGIPLPEINTLILLDREVDMITPMLTQLTYEGLIDEFLGVKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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