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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003965`

染色体: Chr03 坐标: 58688214-58688930 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003965`
名称	SmilChr03G003965
描述	SKP1-like protein 11
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58688214 - 58688930 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014821`
GeneID	`131014821`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014821`
原始查询	`SmilChr03G003965`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SKP1-like protein 11
产物	SKP1-like protein 11
Arabidopsis	`AT4G34210` (SK11) SKP1-like 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829569] identity=41.6; qcov=1.14; evalue=9.71e-31; confidence=medium
Rice	`Os08g0375700` (OSK15) - identity=39.1; qcov=1.23; evalue=5.65e-28; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0097602 (cullin family protein binding)
KEGG	smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01466 (Skp1); PF03931 (Skp1_POZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014821

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057798900.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798900.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057798900.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798900.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798900.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58688507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B23,B71,C73
`Chr3:58688791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B93,B99
`Chr3:58688803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798900.1

131 aa

131

Skp1_POZ

Skp1

PF03931 Skp1_POZ 11-68 aa PF01466 Skp1 85-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798900.1`	Pfam	`PF03931`	Skp1_POZ	Domain	11	68	1.7e-17	64.0	Skp1 family, tetramerisation domain
`XP_057798900.1`	Pfam	`PF01466`	Skp1	Domain	85	124	4.5e-18	65.5	Skp1 family, dimerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942917.1
TCTCCAAAGTGATCAATAACGAGTTTACGCTATACTCTTGGATCTACTCAGCTTAATTTTCTTCATCAATGGCCGAAATTTCAGCGGAGGAACGAACCCTAACTTTATTGAGCTCCGACGGCGAACGGTTCATGGTCCCCGAAGCCGCCGCCGTGCAATCAAAAACGATCAAGAATATCGTGGAGGATGGGTGCAGCGGCGGCCCGATCCCGCTCGCCAATGTCAGCTCTAAAGTACTGGCTGAGGTCATCGTCTTCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014821
ATGGCCGAAATTTCAGCGGAGGAACGAACCCTAACTTTATTGAGCTCCGACGGCGAACGGTTCATGGTCCCCGAAGCCGCCGCCGTGCAATCAAAAACGATCAAGAATATCGTGGAGGATGGGTGCAGCGGCGGCCCGATCCCGCTCGCCAATGTCAGCTCTAAAGTACTGGCTGAGGTCATCGTCTTCCTTAAAAATCACGCGAATGGCAGCGAGATCGAGGAACAGAAGAAAAGCGACGAGACATTCCTGAAGGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798900.1
MAEISAEERTLTLLSSDGERFMVPEAAAVQSKTIKNIVEDGCSGGPIPLANVSSKVLAEVIVFLKNHANGSEIEEQKKSDETFLKEIADRIRDKSPEWVRNLFGIENDYTPEEEEAVRMEYAWAFDDINDD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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