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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003980`

染色体: Chr03 坐标: 58815363-58818421 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003980`
名称	SmilChr03G003980
描述	organelle RRM domain-containing protein 2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58815363 - 58818421 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014837`
GeneID	`131014837`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014837`
原始查询	`SmilChr03G003980`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	organelle RRM domain-containing protein 2, mitochondrial-like
产物	organelle RRM domain-containing protein 2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G37510` (AT2G37510) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818327] identity=55.9; qcov=1.01; evalue=2.36e-44; confidence=medium
Rice	`Os03g0278800` - identity=60.1; qcov=0.987; evalue=1.33e-54; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014837

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057798935.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057798935.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798935.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798935.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798935.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58815585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B22
`Chr3:58815608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr3:58815680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:58815698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B21,B98,C26,C87
`Chr3:58815741`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A15,A7,B139,D2,D6
`Chr3:58815741`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A15,A7,B139,D2,D6
`Chr3:58815743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B42,B43
`Chr3:58815821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr3:58817312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B44,B61,C72
`Chr3:58817321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B31,C50,C80
`Chr3:58817325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B29,B52,B77
`Chr3:58817327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798935.1

150 aa

150

RRM_1

PF00076 RRM_1 42-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798935.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	42	108	1.9e-19	70.0	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942952.1
TCAATAATTACCTTTTATTATAATATAATATTTACTTCATCAAATAAATAAAAATACAAATCCCCATCCATAAAAGTAATAATTATTGTGAACAAATGTAATAATTTTAAAATATTACATTTATGCATATTAATAATTAATACTTTTTATTATGATAATATTTACTTCATCAAATAAATAAAAGTACAAATTCTTATTCATAAAAGTAATAATTATTGTGAACAAATGCAATTATTTTAAAGCATTACTTTTTTTCATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014837
ATGGCCTTCGCTTCAGCTTTCCGTCGCGTTTTTAACGGATCATCCACGCCGTCGCTCAATATACGCTCGCAGTTCTGTTCGATTCGCTTCAGTTCCACGCTTCCGACGCTCACCTCTCCTAAGCTCTTCATCAGCGGTCTTTCAAGAACGACAACTGATGATAACCTATACAAGGCATTTGCACCTTTTGGAAATCTTCGTGAGGCAAAAATTATCATTGACAGAGGCTCTGGGAAATCAAGGGGGTTCGGTTTTGTAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798935.1
MAFASAFRRVFNGSSTPSLNIRSQFCSIRFSSTLPTLTSPKLFISGLSRTTTDDNLYKAFAPFGNLREAKIIIDRGSGKSRGFGFVTYDTVEEAEKAREGMNAKFLDGWVIFVDPAKPREAPQQPPPPRRDMQSTETGYTTNRTVGWSGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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