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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003983`

染色体: Chr03 坐标: 58831502-58834618 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003983`
名称	SmilChr03G003983
描述	uncharacterized SmilChr03G003983
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58831502 - 58834618 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014840`
GeneID	`131014840`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014840`
原始查询	`SmilChr03G003983`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014840

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057798940.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057798940.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798940.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057798941.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798940.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58831702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B85
`Chr3:58831705`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A2
`Chr3:58831705`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A2
`Chr3:58831706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B85
`Chr3:58831726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B28,C45
`Chr3:58831735`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A19,A3,B129,B41,B71,C10,C13,C26,C37,C41,C44,C6,D6
`Chr3:58831737`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B96
`Chr3:58831737`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B96
`Chr3:58831742`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B140,B85
`Chr3:58831742`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B140,B85
`Chr3:58831743`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	53	A10,A16,A21,A25,B102,B103,B108,B113,B114,B120,B121,B123,B133,B134,B136,B138,B139,B15,B26,B38,B39,B44,B45,B48,B49,B5,B50,B52,B56,B59,B61,B79,B81,B87,B91,B93,B95,C1,C10,C12,C18,C26,C4,C41,C46,C52,C53,C57,C61,C64,C66,C85,D8
`Chr3:58831821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B65,C69,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798940.1

439 aa

220

439

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 50-242 aa PF07734 FBA_1 59-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798940.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	50	242	1.5e-08	34.8	F-box associated beta propeller domain
`XP_057798940.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	59	251	3.8e-12	46.6	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942957.1
AAAGAGTATATATAAATATACCTCGCTGCTGCTGCCAGTCCAAATGGTATTGCATAAAGCGTTACAACAATGTTTCAGCTATCAAGATGAGGAAAAAAACAGAAACAGAGTCGGTTAAAAGCTATGTTGGTGTTTAAGGCATTCAGAAATGTTTATGAACAACTTACCACACAAAAAGCACTGAGGTTTGAAGCTATGGATTTGGTAAAAGCCCTGAAAGCAAAATTAGCAGCTCAAACGACCACCATTCGAGACTAGAC...

XM_057942959.1
TTAGGGGTCATTCCCTTTCTTCCAAATCCATGAAATTTTGATCGACGATGAAGAATTCCGACAACAAACGGCTTCTTGTGATACGTAGCTGTGGAAAGTCGGGTGTTGTTTGCATGTGGGATCGACATCCTAAACCCGGTTATGATTATGAGCTTTGGGTATGGAGTGAAAACCCAATGGGGTGGGATAGAATGTTTAGTGTGTCTCTTGGTGGCTCTGTGGGTAGACCACCGGGGACTATATGCGAAACATTCTTGTTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131014840
ATGAAGAATTCCGACAACAAACGGCTTCTTGTGATACGTAGCTGTGGAAAGTCGGGTGTTGTTTGCATGTGGGATCGACATCCTAAACCCGGTTATGATTATGAGCTTTGGGTATGGAGTGAAAACCCAATGGGGTGGGATAGAATGTTTAGTGTGTCTCTTGGTGGCTCTGTGGGTAGACCACCGGGGACTATATGCGAAACATTCTTGTTTCTTGGAGGAATGGCTGGCAAACCGGGTGCTGATGAACATCGTCTAGT...

LOC131014840
ATGAAGAATTCCGACAACAAACGGCTTCTTGTGATACGTAGCTGTGGAAAGTCGGATTATAGGAGGTCCCAAACTTTTGAGTTGTATTCGTTCCGCCAGGATTCTTGGAGCGAAATTCCCTTTGATAATCTTGAAGATATATATATGTCTGGTTTTAGAGCCACGTCTGTTAGAGGTAAAGTTTATTGGTTTAATTTGTGTAACCGAATTGTATCGTTGGATTGTAGTAAGAAAAGTTTATCTTACATTGATTTACCAGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057798940.1
MKNSDNKRLLVIRSCGKSGKYQFTALSPRDLSEIGEESFDLPFLYPRPEISFNCYRDWICIYEYEGHFYLWNPTTKQCLFFPTEKLSTFDETMTSLLGACVCYDSKSNEYKILRVCQGDFLDVEYDDDGYADYRRSQTFELYSFRQDSWSEIPFDNLEDIYMSGFRATSVRGKVYWFNLCNRIVSLDCSKKSLSYIDLPVERRPFELGELVQFNGGDSLGVVCMWDRHPKPGYDYELWVWSENPMGWDRMFSVSLGGSVG...

XP_057798941.1
MKNSDNKRLLVIRSCGKSDYRRSQTFELYSFRQDSWSEIPFDNLEDIYMSGFRATSVRGKVYWFNLCNRIVSLDCSKKSLSYIDLPVERRPFELGELVQFNGGDSLGVVCMWDRHPKPGYDYELWVWSENPMGWDRMFSVSLGGSVGRPPGTICETFLFLGGMAGKPGADEHRLVAYDWTKKDCKELGIHDHRFDIHVLCYVEGTFVLPHGKPINGSSFLINPRFVKWPERFLNCDNHYCNCNCHFVDIFPEIKVYNCEC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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