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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003995`

染色体: Chr03 坐标: 58993208-58995627 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003995`
名称	SmilChr03G003995
描述	GATA transcription factor 8-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58993208 - 58995627 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014852`
GeneID	`131014852`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014852`
原始查询	`SmilChr03G003995`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GATA transcription factor 8-like
产物	GATA transcription factor 8-like
Arabidopsis	`AT4G32890` (GATA9) GATA transcription factor 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829425] identity=40.3; qcov=1.02; evalue=7.2e-48; confidence=medium
Rice	`Os01g0745700` (OsGATA6) - identity=34.8; qcov=1.19; evalue=3.71e-40; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00320 (GATA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014852

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798954.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798954.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798954.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798954.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798954.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58994586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B22
`Chr3:58994613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:58995184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B73,C29
`Chr3:58995202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr3:58995215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798954.1

263 aa

132

263

GATA

PF00320 GATA 191-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798954.1`	Pfam	`PF00320`	GATA	Domain	191	224	1e-14	54.6	GATA zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942971.1
ATTCCCGTGTACGCCCACACATTTACACCTCCAATGGCACTGTACATGTGATTGCAGGGGAAGGGGGAGAGCGGTGGGAGTGGTGTGGGACCCGTGCTCTTGCAAGCCTTAAACATCACGACAGTGAAGCCTGAGTGTAAAAGACAGCTTGCATTGAAGCAAGAATTTCACCTACCATTTCTTCTCTCTCTCTCACTCACTCACTATTTTTAGCCTTCTCTTTCTCACTTCCTTCCTCTTCATATTCACTCTCACGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014852
ATGGAGCCAGAGTTGATAGACGAAATCGAGTGTGGAAACTTCTTCGACCAAATGGATGACTTGATTGAGTTTCCCCCCGACAATGAGTGTGCTGATGATGCTAACTTAGTTAGCTCCAGTGATTTCCCCACGTGGGACGAGGCGTTGCAGGGCTGCGACACCCTCTTCTCCGGCAGCCCTGCTTCCGACCTTGCTGCAGAGCTCTCTGTTCCGTATGAGGATATAGTTCAATTGGAGTGGCTTTCGACGTTTGTGGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798954.1
MEPELIDEIECGNFFDQMDDLIEFPPDNECADDANLVSSSDFPTWDEALQGCDTLFSGSPASDLAAELSVPYEDIVQLEWLSTFVEDSFSGGGLTVGKEKKEQLSPVSVVESSTSSSSSSAVPLSPRHRGPQRARSKRPRPPMFNPRPAIQLISPASSESNSFAESSPSKKSKKIKITLPATPTPQPLRKCLHCEITKTPQWRAGPMGPKTLCNACGVRYKSGRLFPEYRPAASPTFVPSLHSNSHKKVIEMRCKVEPMI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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