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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004000`

染色体: Chr03 坐标: 59035040-59038488 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004000`
名称	SmilChr03G004000
描述	mRNA-decapping enzyme subunit 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59035040 - 59038488 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014859`
GeneID	`131014859`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014859`
原始查询	`SmilChr03G004000`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mRNA-decapping enzyme subunit 2-like
产物	mRNA-decapping enzyme subunit 2-like
Arabidopsis	`AT5G13570` (DCP2) decapping 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831201] identity=59.9; qcov=1.17; evalue=1.76e-158; confidence=high
Rice	`Os02g0805900` (OsDCP2) - identity=66; qcov=0.997; evalue=1.52e-153; confidence=high
GO	GO:0000184 (nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay); GO:0000290 (deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0030145 (manganese ion binding); GO:0140933 (5'-(N(7)-methylguanosine 5'-triphospho)-[mRNA] hydrolase activity)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00293 (NUDIX); PF05026 (DCP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014859

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798969.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.80000	`XP_057798969.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057798969.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057798969.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798969.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59035295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:59036025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr3:59036247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:59036911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B122,B52,C61
`Chr3:59037226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:59037306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr3:59037518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C31,D3
`Chr3:59037542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:59037738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B14,B69,B70,C28
`Chr3:59038048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C62,D6
`Chr3:59038060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B23,B7,C1
`Chr3:59038087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B85,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798969.1

319 aa

160

319

DCP2

NUDIX

PF05026 DCP2 20-102 aa PF00293 NUDIX 106-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798969.1`	Pfam	`PF05026`	DCP2	Domain	20	102	3.5e-30	104.8	Dcp2, box A domain
`XP_057798969.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	106	218	3.4e-14	53.7	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942986.1
GTCTAAAAAAAAGTAATCCTTTTTTCTTCAAAAAAAAAAGGTCATCCGCTCTGTATTAATTTATGTATTAAAAAATACATCATTTTACAATTAATTATTCCGATAATATTTTTTAGAAAATAAATTATTCCAATAAAACATATATCGAGACTTGTATATTTTTACCCAAAATATTTGAGAAGGGAAGGCCTAGGCTTTGATGAAAAGAAAGAATGTCAGGCATGAACCGATCTGCAATCGCTCCATCCAAGTATGCCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014859
ATGTCAGGCATGAACCGATCTGCAATCGCTCCATCCAAGTATGCCCTTCCCCCTAAAGAGCTCCTCGACGATCTCTGCAGTCGTTTTGTTCTAAATGTGCCTAAGGAAGACCAGCAGTCGTTCGAGAGGATTTTGTTTCTCGTGGAGTATGCACATTGGTTTTATGAAGATAACTCGGTTGAAAAGAATCCATCTCTGAAGTCGTTAACCTTGAAGGAATTTACTTCCTTATTGTTCAACAACTGTAATGTCTTAAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798969.1
MSGMNRSAIAPSKYALPPKELLDDLCSRFVLNVPKEDQQSFERILFLVEYAHWFYEDNSVEKNPSLKSLTLKEFTSLLFNNCNVLKPYVAHIDDIFKDFTSYKVRVPVTGAIILDETYERCLLVKGWKGTSWSFPRGKKNKDEEDHSCAIREVLEETGFDVSKLINKDEYIEMIFGQQRVRLYIVAGVKDDTLFAPLTKKEISEIAWQVIDELQHANADVISRGSTGLKLYMVAPFLASLKSWISVHPPPMSPRPDRPAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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