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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004004`

染色体: Chr03 坐标: 59061400-59067931 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004004`
名称	SmilChr03G004004
描述	protein REBELOTE
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59061400 - 59067931 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014862`
GeneID	`131014862`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014862`
原始查询	`SmilChr03G004004`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein REBELOTE
产物	protein REBELOTE
Arabidopsis	`AT3G55510` (RBL) Noc2p family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824716] identity=50.3; qcov=0.711; evalue=1.34e-175; confidence=high
Rice	`Os12g0163200` - identity=43.2; qcov=0.942; evalue=2.83e-173; confidence=medium
GO	GO:0005654 (nucleoplasm); GO:0005730 (nucleolus); GO:0030690 (Noc1p-Noc2p complex); GO:0030691 (Noc2p-Noc3p complex); GO:0042273 (ribosomal large subunit biogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF03715 (Noc2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014862

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798972.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057798972.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.60000	`XP_057798972.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057798972.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798972.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59062856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B23,B7,C1
`Chr3:59062884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C62,D6
`Chr3:59062900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B118,B8,C33
`Chr3:59063129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B57,B71,C62,C72,D6
`Chr3:59063261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:59065023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr3:59065033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B30,B73,B83,C69
`Chr3:59065038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:59065107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B8,C33
`Chr3:59065126`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B125
`Chr3:59065126`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B125
`Chr3:59065176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798972.1

722 aa

361

722

Noc2

PF03715 Noc2 364-656 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798972.1`	Pfam	`PF03715`	Noc2	Family	364	656	2.4e-81	273.9	Noc2p family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942989.1
AATGAGAGGCCCAATACTTTTATTTAGGGCATCTTTTAAATTAGGCAAGGCCCAAGCTTTTGTTTCTCCTCTCGCTCCCCCTTCCCCTTCTCTTTCCTCTTCCTTTTCCGGCGAAAGACTCTCCTTCAGTTCCTGCCGCCTTTACGCAGCCACCTCTCTCCGTCTGCGCATCTCCATCCATCGCCGACACGCCTCCGCCTCCGAAATTGCATAATCAAGGAGTGAGAATTTCATGGGTAAACTAGGAAAGAAGGCGCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014862
ATGGGTAAACTAGGAAAGAAGGCGCGAAAATTTGCGAAGAAGCATCTTCAGTCTGTGCTAAAGCAGCGGCGAAAAACGAAAGCTTTATTCAAGAGGAAAGCTCCAAAAGACGGGCAACATGATGATATCAAGGAGACAGCGGAGAACCCTGCAGGCACTTTTAATGGAAGGAGCAGTGAACCCGAGAGCACTGTAATTACTTCTCTTGATGCAGCATTCACTGAAAATGGAACAGATGAGATTGCACTTGCATCAGACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798972.1
MGKLGKKARKFAKKHLQSVLKQRRKTKALFKRKAPKDGQHDDIKETAENPAGTFNGRSSEPESTVITSLDAAFTENGTDEIALASDSDGYLSEDPSCAYAVESETGKTLEDKITTVYSAQNNKIQSDLGALKKKLDRLRKKDPGFNYFLESFNSSAETIQNEDSCSDEGDSSDQEERGEDDLAKDKEKFLSNQVIVTWCRMVKEDNSQLAFISLLNAYRAACHYGVESVGHRIDSSETFCNILIFTLSNADDVFRGILQI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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