当前解析结果
SmilChr03G004007| 统一新 Gene ID | SmilChr03G004007 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G004007 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G004007 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 59084532 - 59085631 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014865 |
|---|---|
| GeneID | 131014865 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014865 |
| 原始查询 | SmilChr03G004007 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014865 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057798974.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057798974.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057798974.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057798974.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798974.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:59084745 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 11 | A16,B103,B136,B26,B44,B50,B59,B60,B61,D1,D8 |
Chr3:59084746 |
A |
ACG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 18 | A10,A21,B100,B107,B114,B25,B4,B49,B74,B79,C2,C25,C5,C58,C63,C79,C85,C9 |
Chr3:59084809 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B22,B35,B97,C33,C82 |
Chr3:59084902 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr3:59084971 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C47 |
Chr3:59085035 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 71 | A10,A18,A20,A9,B105,B108,B111,B119,B12,B124,B132,B134,B15,B16,B18,B20,B29,B3,B31,B33,B37,B38,B39,B41,B46,B47,B5,B52,B58,B60,B62,B63,B70,B72,B77,B78,B80,B87,B93,B96,C1,C14,C15,C16,C17,C19,C23,C24,C27,C3,C30,C34,C37,C38,C4,C40,C42,C44,C46,C47,C48,C65,C70,C75,C76,C78,C80,C81,C83,C85,D9 |
Chr3:59085057 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C47 |
Chr3:59085063 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A22,C40 |
Chr3:59085078 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B32 |
Chr3:59085087 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B32 |
Chr3:59085117 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B22 |
Chr3:59085246 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B98,C18,C35,C48,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。