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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004016`

染色体: Chr03 坐标: 59149784-59152871 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004016`
名称	SmilChr03G004016
描述	serine carboxypeptidase-like 27
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59149784 - 59152871 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014908`
GeneID	`131014908`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014908`
原始查询	`SmilChr03G004016`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine carboxypeptidase-like 27
产物	serine carboxypeptidase-like 27
Arabidopsis	`AT2G35770` (scpl28) serine carboxypeptidase-like 28 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818149] identity=59.8; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0833500` (OsSCP5) - identity=59.8; qcov=0.924; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004185 (serine-type carboxypeptidase activity); GO:0005773 (vacuole); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00450 (Peptidase_S10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014908

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057799043.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057799043.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799043.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799043.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799043.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59150296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,B97,C33
`Chr3:59150435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr3:59150572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B75
`Chr3:59150678`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	58	A13,A18,A21,A24,A4,A6,B101,B102,B103,B105,B106,B108,B118,B12,B120,B122,B125,B126,B127,B133,B139,B20,B21,B25,B3,B33,B45,B53,B54,B58,B62,B65,B7,B72,B75,B78,B85,B89,B94,B99,C11,C2,C23,C24,C27,C37,C5,C50,C52,C58,C6,C61,C69,C7,C72,C74,C80,C84
`Chr3:59150750`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	63	A1,A11,A15,A16,A3,A9,B1,B103,B107,B108,B112,B113,B117,B121,B125,B130,B136,B138,B16,B2,B20,B21,B23,B26,B28,B3,B38,B39,B44,B50,B52,B56,B59,B6,B60,B61,B63,B64,B66,B7,B71,B85,B87,B93,B94,B96,C1,C12,C13,C19,C31,C41,C61,C67,C71,C73,C8,C82,C83,D1,D10,D3,D8
`Chr3:59150754`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	104	A10,A14,A20,A22,A25,A4,A6,A8,A9,B105,B109,B112,B119,B122,B128,B132,B134,B135,B15,B16,B18,B22,B29,B31,B32,B33,B35,B37,B38,B39,B41,B46,B47,B49,B5,B51,B52,B56,B60,B62,B63,B68,B69,B70,B72,B74,B75,B77,B80,B81,B9,B90,B92,B93,B94,B96,B97,B98,C1,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C22,C23,C25,C3,C30,C33,C34,C35,C37,C38,C4,C40,C42,C46,C47,C48,C49,C50,C6,C60,C64,C65,C66,C70,C71,C72,C75,C76,C78,C81,C82,C83,C85,C9,D10,D5,D7,D8,D9
`Chr3:59150757`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B104,D11
`Chr3:59150757`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr3:59150853`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B105,B88,C1,C38,C40
`Chr3:59151016`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B69
`Chr3:59151016`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B69
`Chr3:59151019`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799043.1

496 aa

248

496

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 50-488 aa

XP_057799044.1

463 aa

232

463

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 50-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799043.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	50	488	3.8e-135	452.2	Serine carboxypeptidase
`XP_057799044.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	50	455	9.4e-140	467.4	Serine carboxypeptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943061.1
CATTACCAAAACCTTTGGTTACTTAGGTCAATATTCACACTTTGATATTAATTTGGTCACATTTTTATATTTCCAAAGATCTATTTTGGATCACAAAATTAGGCTGGCAAGGGATCAAGATTTGCTTGCTAACTTACCATCAATGCTGATCACATGCATGAGCCCATTTCACGGTATTATATTTCCACATTCATACTTACCTTAAATTCTACTCTAAAAATTACAACCTATCACGTTTAATTTTCTTTAAATTTGTGTAA...

XM_057943060.1
TTTGGTTACTTAGGTCAATATTCACACTTTGATATTAATTTGGTCACATTTTTATATTTCCAAAGATCTATTTTGGATCACAAAATTAGGCTGGCAAGGGATCAAGATTTGCTTGCTAACTTACCATCAATGCTGATCACATGCATGAGCCCATTTCACGGTATTATATTTCCACATTCATACTTACCTTAAATTCTACTCTAAAAATTACAACCTATCACGTTTAATTTTCTTTAAATTTGTGTAATAAACATGCACAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014908
ATGAGAGAGCTTTCCCTCCACTCTCTCCGATGTGTTTTCAAGCCTATCTTCGTCTCAATACTACTGTGTTTGTTGGTATCTCCTCTTGCCACGTCAACAAACCTAAGATACCCTAAACAACAAGAGAGAGATAGGATCATCAAACTTCCCGGGCAACCATCGAATGTGAGTTTCTCACAATACTCGGGCTACGTCACCGTGGACGCGAAGGCGGGCCGGGCCCTTTTCTATTGGCTGGTGGAGGCGAGCAAGAAGCCCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799043.1
MRELSLHSLRCVFKPIFVSILLCLLVSPLATSTNLRYPKQQERDRIIKLPGQPSNVSFSQYSGYVTVDAKAGRALFYWLVEASKKPESKPLVLWLNGGPGCSSIAYGASEEVGPFRVRPDGQTLSLSRHAWNREANLLFLDSPAGVGFSYSNSSSDQRTGDKRTGSIPLFIYVEILCIAALVHHLTKFEFIYFSKCTGNDAYQFLRRWFERFPQFKYRTFYIAGESYAGHYIPELSKIIVDRNNPIINFKGFLLGNPLID...

XP_057799044.1
MRELSLHSLRCVFKPIFVSILLCLLVSPLATSTNLRYPKQQERDRIIKLPGQPSNVSFSQYSGYVTVDAKAGRALFYWLVEASKKPESKPLVLWLNGGPGCSSIAYGASEEVGPFRVRPDGQTLSLSRHAWNREANLLFLDSPAGVGFSYSNSSSDQRTGDKRTGNDAYQFLRRWFERFPQFKYRTFYIAGESYAGHYIPELSKIIVDRNNPIINFKGFLLGNPLIDDFYDNIGTFEFWWNHGLVGDSTYSQLNESCPRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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