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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004017`

染色体: Chr03 坐标: 59154831-59157772 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004017`
名称	SmilChr03G004017
描述	tetraspanin-6
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59154831 - 59157772 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014935`
GeneID	`131014935`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014935`
原始查询	`SmilChr03G004017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetraspanin-6
产物	tetraspanin-6
Arabidopsis	`AT3G12090` (TET6) tetraspanin6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820383] identity=64.9; qcov=1; evalue=3.03e-125; confidence=high
Rice	`Os05g0126100` (OsTET8) - identity=66; qcov=0.943; evalue=9.93e-121; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0009734 (auxin-activated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00335 (Tetraspanin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014935

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799100.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799100.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799100.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799100.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799100.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59155153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr3:59155168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:59155171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C71
`Chr3:59155172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:59155201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr3:59155222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,D6
`Chr3:59155301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,D6
`Chr3:59156741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C31
`Chr3:59157578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B71,C62,D7
`Chr3:59157591`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B99
`Chr3:59157591`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799100.1

281 aa

140

281

Tetraspanin

PF00335 Tetraspanin 6-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799100.1`	Pfam	`PF00335`	Tetraspanin	Family	6	240	5.7e-35	121.7	Tetraspanin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943117.1
GGTCAATACATGAAGCATATATATGGATCTTGATCACCATATTAAAAGCACTCTCCCATTTCCATACCTTATTAATTCCAAGGAACTAAAGCAACTCACTTTAGCTACTCTTATAGGAGTATTTTCTTTTCCACCAAACAATTCACACACACACAACAAAAGATAAAGCTGATGATGATCGTGATAAAACATCAACACTACCCCAAAAATTAAACTAGAAGCACTCTCCATACACACACACTAGCTAGCTAAGCCTAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014935
ATGTATCGATTCAGCAACTCAGTTATAGGTTTCTTGAACCTCTTCACCCTCCTGGCCTCGATCCCGATAATCGGGGCGGGGCTGTGGATGGCGAGGAGTAGCACGACGTGCGAGAGCTTCCTCCAAACACCCCTTTTGGTGGTAGGGTTCATAGTCCTGATAATATCTCTGGCCGGTTTCATAGGCGCGTGTTTCCACGTTGCATGGGCGCTGTGGGTTTACCTGGTCATCATGCTGCTGCTCATCGGCGCGCTCATGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799100.1
MYRFSNSVIGFLNLFTLLASIPIIGAGLWMARSSTTCESFLQTPLLVVGFIVLIISLAGFIGACFHVAWALWVYLVIMLLLIGALMGLTIFGFVVTSPGGGTAVAGRTYREYHLDSYSSWLKKRVLDTHYWMTIRSCILGSKTCDKIVLWTPFDYLTKDLTPIQSGCCKPPTACNYAATMVAQDPDCYRWNNAAAVLCYECESCKAGVLEDVRRSWHKLSVLNIVMVVVLIGIYSIGCCAFQNAKRAHTDYPYGHNRMSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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