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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004020`

染色体: Chr03 坐标: 59184843-59189099 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004020`
名称	SmilChr03G004020
描述	MLO-like protein 6
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59184843 - 59189099 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014904`
GeneID	`131014904`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014904`
原始查询	`SmilChr03G004020`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MLO-like protein 6
产物	MLO-like protein 6
Arabidopsis	`AT1G61560` (MLO6) Seven transmembrane MLO family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842450] identity=54.9; qcov=1.09; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0129100` (OsMLO2) - identity=43.2; qcov=1.05; evalue=6.92e-137; confidence=medium
GO	GO:0006952 (defense response); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03094 (Mlo)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014904

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799038.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799038.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799038.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799038.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59185243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B124,B78
`Chr3:59185277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:59185650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,C33,D10
`Chr3:59186144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,C54
`Chr3:59186352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C48
`Chr3:59186370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C49,D10,D4
`Chr3:59186370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C49,D10,D4
`Chr3:59186382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C23
`Chr3:59186410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,C36,C44,C63,C67
`Chr3:59187689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B38,B39
`Chr3:59187714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr3:59188113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B40,C49,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799038.1

546 aa

273

546

Mlo

PF03094 Mlo 7-103 aa PF03094 Mlo 104-460 aa

XP_057799039.1

484 aa

242

484

Mlo

PF03094 Mlo 1-41 aa PF03094 Mlo 42-398 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799038.1`	Pfam	`PF03094`	Mlo	Family	7	103	2.9e-210	699.5	Mlo family
`XP_057799038.1`	Pfam	`PF03094`	Mlo	Family	104	460	2.9e-210	699.5	Mlo family
`XP_057799039.1`	Pfam	`PF03094`	Mlo	Family	1	41	1.8e-186	621.0	Mlo family
`XP_057799039.1`	Pfam	`PF03094`	Mlo	Family	42	398	1.8e-186	621.0	Mlo family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943055.1
AATTCATCCTATATTTTAACAAGCTAGCTAGCTAGTTGTATCATTTTTCAAAAACTTTTACGAAGTTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGGCATATAGATTAGTACTGATTGAATATTATTTGTTTCACTCTATATAAATACATAACGTAGATTTCATGATCTGCATATTGCTCAGCTAACAATTGACCCACCTAACAATAATTAAGAAAGTGAAGTAGTTCCACACACACCTATATATATATATATATATTG...

XM_057943056.1
TTCTTTTTATCCATAAATGGCAGAGTTGCCTAAGGAGAAGACTTTGGCGGCGACGCCAACGTGGGCGGTGGCCGCCTTTTTCTTCGCGATGGTTGCTATCTCCATCGTCATCGAACAAATAATTCATCATGCTGAATTGGTTCGACTATTGAGAAGTATATCAATTCTCCATTTGATTGCAGTGGTTGAAGAAAAAAAGGAAGGTAGCGCTATTTGAAGCTCTAGGGAAGATTAAAGCAGAGCTTATGCTACTAGGGTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014904
ATGGCAGAGTTGCCTAAGGAGAAGACTTTGGCGGCGACGCCAACGTGGGCGGTGGCCGCCTTTTTCTTCGCGATGGTTGCTATCTCCATCGTCATCGAACAAATAATTCATCATGCTGAATTGTGGTTGAAGAAAAAAAGGAAGGTAGCGCTATTTGAAGCTCTAGGGAAGATTAAAGCAGAGCTTATGCTACTAGGGTTCATATCGTTACTGCTGACAGTGACGCAGGAGACTCTTTCTAATATTTGTGTACCGAAAAA...

LOC131014904
ATGCTACTAGGGTTCATATCGTTACTGCTGACAGTGACGCAGGAGACTCTTTCTAATATTTGTGTACCGAAAAATGTTGGAGATTCTTGGCACCCTTGTAAGGAAGACATATACAGTAAAAAGAAATATTATGATCCATGTCTTGAAAAGGGCACGGTGCAACTTGTTTCAGCATACGGGATACACCAGCTGCATATCTTCATTTTTGTTTTGGCACTTTTTCATATAATCTATTGTGTTGTCACTTACGCCTTGGGAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799038.1
MAELPKEKTLAATPTWAVAAFFFAMVAISIVIEQIIHHAELWLKKKRKVALFEALGKIKAELMLLGFISLLLTVTQETLSNICVPKNVGDSWHPCKEDIYSKKKYYDPCLEKGTVQLVSAYGIHQLHIFIFVLALFHIIYCVVTYALGKLKMRKWKAWEDETQTSEYQYYHDPERFRFARETSFGRRHLRFWNRSSLLLWIVCFFRQFFPSVAKVDYLTLRHGFVTEHLPPQIRATFDFQVYINKALEEDFKVIVGISPA...

XP_057799039.1
MLLGFISLLLTVTQETLSNICVPKNVGDSWHPCKEDIYSKKKYYDPCLEKGTVQLVSAYGIHQLHIFIFVLALFHIIYCVVTYALGKLKMRKWKAWEDETQTSEYQYYHDPERFRFARETSFGRRHLRFWNRSSLLLWIVCFFRQFFPSVAKVDYLTLRHGFVTEHLPPQIRATFDFQVYINKALEEDFKVIVGISPALWFCAVLFLLTNTNGWYSDFWLPFIPLIIILLVGAKLQVIITKMGIRVLDRGDVVRGSPLVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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