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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004051`

染色体: Chr03 坐标: 59467771-59472864 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004051`
名称	SmilChr03G004051
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59467771 - 59472864 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014874`
GeneID	`131014874`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014874`
原始查询	`SmilChr03G004051`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=27.2; qcov=0.702; evalue=5.84e-64; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=28.6; qcov=0.71; evalue=4.23e-73; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014874

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057798992.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057798992.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057798992.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798992.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798992.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59468034`	`AT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A4,B117,C20,C59,C65
`Chr3:59468060`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A8,B102,B12,B122,B136,B44,B65,B97,C21,C29,C33,C36,C40,C47,C50,C55,C71,D6
`Chr3:59468064`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A8,B102,B12,B122,B136,B44,B65,B97,C21,C29,C33,C36,C40,C47,C50,C55,C71,D6
`Chr3:59468092`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A16,A3,B104,B119,B13,B79,B84,B88,C12,C31,C46,C60,C80
`Chr3:59468101`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	70	A14,A18,A2,A6,A7,B101,B106,B107,B109,B110,B113,B119,B120,B126,B129,B134,B136,B138,B20,B22,B23,B26,B28,B29,B3,B33,B44,B47,B48,B52,B54,B57,B58,B59,B60,B7,B70,B76,B78,B8,B80,B84,B9,C13,C15,C17,C18,C2,C25,C27,C28,C29,C3,C35,C47,C49,C5,C50,C52,C55,C58,C61,C63,C72,C78,C79,C84,D5,D8,D9
`Chr3:59468104`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	70	A14,A18,A2,A21,A6,A7,A8,B101,B107,B109,B110,B113,B119,B126,B129,B134,B136,B138,B20,B22,B23,B26,B28,B29,B3,B33,B44,B47,B48,B52,B54,B57,B58,B59,B60,B7,B70,B76,B78,B8,B80,B84,B9,B92,C15,C18,C2,C25,C27,C28,C29,C3,C33,C35,C47,C49,C5,C50,C52,C55,C58,C6,C61,C72,C78,C79,C84,D5,D8,D9
`Chr3:59468126`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B129,C24,C75
`Chr3:59468126`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B129,C24,C75
`Chr3:59468183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B72,C37
`Chr3:59468278`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A1,B121,B16,C37,D4
`Chr3:59468278`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A1,B121,B16,C37,D4
`Chr3:59468281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,A9,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798992.1

1233 aa

616

1233

NB-ARC

WHD_DRP

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 137-308 aa PF23559 WHD_DRP 391-463 aa PF00931 NB-ARC 868-1041 aa PF23559 WHD_DRP 1130-1196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798992.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	137	308	6.2e-76	254.5	NB-ARC domain
`XP_057798992.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	391	463	2.6e-32	111.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057798992.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	868	1041	6.2e-76	254.5	NB-ARC domain
`XP_057798992.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	1130	1196	2.6e-32	111.4	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943009.1
ATCTCTCTCCCCTCTGTGTCGACTCTGGAGTGTCGGTTCTCTCTCTCTCGCACACAGACTCAGCATCAGTATGGCAGCTTATGCTGCTCTTCTTTCCCTTGCTCAAACTACACATCTCAATACATATCAACATCAATCTCTCTTTTCTTCCGAAGCAGAAGAAAAAGTTAGATCAATCCACGACTATGTCAGTTTCTTGCTATTGTTCTTTGAAGATTTTCCACAGAAAGTCAACCGTTGGGAAGGAAGGATCAGGGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014874
ATGGCAGCTTATGCTGCTCTTCTTTCCCTTGCTCAAACTACACATCTCAATACATATCAACATCAATCTCTCTTTTCTTCCGAAGCAGAAGAAAAAGTTAGATCAATCCACGACTATGTCAGTTTCTTGCTATTGTTCTTTGAAGATTTTCCACAGAAAGTCAACCGTTGGGAAGGAAGGATCAGGGACGTATCTTATCAAATCGAAGATATTATTGAAGTTTTTATCTGTCACCGAATTCAGCGTCATCCATCACGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798992.1
MAAYAALLSLAQTTHLNTYQHQSLFSSEAEEKVRSIHDYVSFLLLFFEDFPQKVNRWEGRIRDVSYQIEDIIEVFICHRIQRHPSRVKLEGQLQNVMEEIGLIAGEVMEERPTYLPASSSSSSRLASTGNDAVIGLDDDITAIKERLCGQSPNLRVVPIVGMGGIGKTTLAKAVYDDQLIIERFDIRAWVVASQDYSPHRFRKLLLDSMKLLEDQMSTDVIDESDIDSKVCKKLKGWRYLIVIDDVWGTNIWDDVRYMFP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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