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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004052`

染色体: Chr03 坐标: 59473631-59481295 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004052`
名称	SmilChr03G004052
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59473631 - 59481295 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014877`
GeneID	`131014877`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014877`
原始查询	`SmilChr03G004052`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=27.8; qcov=0.885; evalue=4.08e-72; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=27.9; qcov=0.932; evalue=3.04e-78; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014877

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057798995.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798995.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798995.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798995.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798995.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59478691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr3:59478745`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B120
`Chr3:59478745`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B120
`Chr3:59478866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:59478918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:59479051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:59479314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C38
`Chr3:59479394`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A19,A4,A8,B10,B104,B112,B114,B121,B122,B130,B16,B17,B24,B25,B30,B51,B65,B72,B73,B74,B75,B94,B97,B98,C20,C33,C36,C37,C42,C50,C60,C87,D4
`Chr3:59479407`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	56	A13,A18,A23,A24,A5,B102,B104,B12,B123,B124,B125,B128,B13,B131,B139,B14,B19,B20,B27,B3,B32,B36,B45,B5,B53,B55,B58,B62,B77,B78,B79,B87,B94,B98,B99,C10,C12,C16,C24,C26,C39,C4,C51,C52,C53,C55,C57,C59,C61,C64,C66,C80,C87,D3,D5,D7
`Chr3:59479410`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	53	A13,A18,A23,A24,A5,B102,B12,B123,B124,B125,B128,B13,B131,B139,B14,B19,B20,B27,B3,B32,B36,B45,B5,B53,B55,B58,B62,B77,B78,B79,B87,B94,B99,C10,C12,C16,C24,C26,C39,C4,C51,C52,C53,C55,C57,C59,C61,C64,C66,C80,D3,D5,D7
`Chr3:59479423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B8,C33,C42,D11
`Chr3:59479424`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	188	A11,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B10,B100,B101,B102,B104,B107,B108,B109,B110,B112,B113,B114,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B80,B82,B84,B86,B87,B9,B90,B92,B93,B94,B97,B98,B99,C10,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C22,C24,C25,C26,C27,C28,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C42,C44,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C57,C58,C59,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C71,C72,C73,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C87,C9,D1,D2,D3,D4,D5,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798995.1

897 aa

448

897

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 140-328 aa PF23559 WHD_DRP 407-480 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798995.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	140	328	5.4e-41	140.8	NB-ARC domain
`XP_057798995.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	407	480	3.1e-20	72.7	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943012.1
GAGAAAGTCAATCACCTCTCACTCCCACACACAAAATTTAAGGGCAGAGCTCCAGCGATCGCCCAGTATGGCAGCTTATGCCGCTCTTGCTTCCCTTTCTCAAACTACACATCTAACTATCAACCAACACAAATCCCTCTTTTCTATCGACGCGGAAGAAAGAATTAGATCCATCCACGAGTATGTCATTTTCTTGCTATCGTTCCTCCAAGATTTTCCGGACAAATCCAAGCGTTGGGAAGTCAAGATGAGGGACGTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014877
ATGGCAGCTTATGCCGCTCTTGCTTCCCTTTCTCAAACTACACATCTAACTATCAACCAACACAAATCCCTCTTTTCTATCGACGCGGAAGAAAGAATTAGATCCATCCACGAGTATGTCATTTTCTTGCTATCGTTCCTCCAAGATTTTCCGGACAAATCCAAGCGTTGGGAAGTCAAGATGAGGGACGTAGCTCATGAAACTGAGGATATTATCGAACAATATCTGTCTCAGCTGTCATATTGCAGATGGATTAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798995.1
MAAYAALASLSQTTHLTINQHKSLFSIDAEERIRSIHEYVIFLLSFLQDFPDKSKRWEVKMRDVAHETEDIIEQYLSQLSYCRWIKPSIVEFEDQLTNVTQKLCLMAGDLMDEGPAHSRLAVSSSRVASTGNSAMVGLDDDLMAIKDRLCGLSSKLQVIPIVGMGGIGKTTLAKNVYDDLLIVEHFHIRVWLTVSQDYSAGKVLLNVLYSIILIEQRMSLGVEDSMELREEQMRREETDDSKMAVEVYKKLKGRRYLIVM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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