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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004059`

染色体: Chr03 坐标: 59539744-59547978 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004059`
名称	SmilChr03G004059
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59539744 - 59547978 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014883`
GeneID	`131014883`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014883`
原始查询	`SmilChr03G004059`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=27.9; qcov=0.999; evalue=4.15e-72; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30.4; qcov=0.866; evalue=1.05e-73; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014883

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057799007.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057799007.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799007.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799007.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59545147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C2
`Chr3:59545178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B122,B56,C83
`Chr3:59545734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B13,D2
`Chr3:59545769`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A15,A16,B111,B24,B28,B88,C71,C86
`Chr3:59545921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C38
`Chr3:59546077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B121,B25,B30,B51,B72,B94,B98,C20,C37,C87
`Chr3:59546548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C38
`Chr3:59546606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B10,B16,D4
`Chr3:59546759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:59546826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,B50,C82
`Chr3:59547068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B137,B22,B83
`Chr3:59547113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B137,B22,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799007.1

836 aa

418

836

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 150-317 aa PF23559 WHD_DRP 400-471 aa PF23598 LRR_14 520-707 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799007.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	150	317	2.8e-40	138.4	NB-ARC domain
`XP_057799007.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	400	471	9.6e-20	71.1	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057799007.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	520	707	1.5e-21	77.3	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098367.1
TGCTGCACAAGTCTCTGGAGTCGTTTTGTAGCTGAAGTTGACAGTTGCTAATTCTTTGAACTCCTCTGTATCTGCTAATCATCCACAATCTCTCTCTCGCTCTCTCTAAATTGTGTGAATTAACAAACCAAATTGAAGTCCTCCATTTGCACAATATGGCAGCTTACGCTGCTCTCGTTTCACTTGCACGCACAACAGAACTGCTGCTGAATTCTGATAAATATTCCATTCCTGTTGATGAAAAAGCACAAATTACATCT...

XR_009098366.1
TTCCATCCGGTCCGATCAACTGGCATCACATGCCAATATGCCATGAAAGCTGCTAGCCCAGTCTGAATTCGGGCCGAACAAATGGGCTAGCCCAGTCTGCCCGGTCCGACCCGATCTTATTTTCCTGCAGTCGACCCGGCCCTTTTGACAATGGTGAGTAGTGACTAGTGAGTACAGAGTATCCAATGCTGCACAAGTCTCTGGAGTCGTTTTGTAGCTGAAGTTGACAGTTGCTAATTCTTTGAACTCCTCTGTATCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014883
ATGGCAGCTTACGCTGCTCTCGTTTCACTTGCACGCACAACAGAACTGCTGCTGAATTCTGATAAATATTCCATTCCTGTTGATGAAAAAGCACAAATTACATCTATCCGCGAGTACGCGATGTTCCTCATATCATCCCTTGAAGATTTTCCAGAGAGATCCAGCCGTCTGGAAGGGAAAATCAAGGATATAGCTAATCAAACCGAAGTTCTCATCGAATATTTTATGTGGAAGCAAATTCGGTTGAACTGGTGTAGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799007.1
MAAYAALVSLARTTELLLNSDKYSIPVDEKAQITSIREYAMFLISSLEDFPERSSRLEGKIKDIANQTEVLIEYFMWKQIRLNWCSVQNLSRSEFDELLTKSREEIGLIVSQTMDGQFVGDSSATISPARLAPTNNNDVVIGLGADLITIKDRLCGASSKLQVIPITGMGGIGKTTLARNAYDDSSIVGYFHIRAWVTVSQHYSAHRILSTLLDSMTLFLKEQVLGEEIDETVMAEKVYKCLKGRRYLVVMDDVWSTEVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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