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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004070`

染色体: Chr03 坐标: 59680409-59681739 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004070`
名称	SmilChr03G004070
描述	protein MODIFYING WALL LIGNIN-1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59680409 - 59681739 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014939`
GeneID	`131014939`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014939`
原始查询	`SmilChr03G004070`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MODIFYING WALL LIGNIN-1-like
产物	protein MODIFYING WALL LIGNIN-1-like
Arabidopsis	`AT1G31720` (AT1G31720) chitin synthase, putative (DUF1218) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840059] identity=47; qcov=0.551; evalue=1.71e-40; confidence=medium
Rice	`Os02g0703300` - identity=43.4; qcov=0.56; evalue=2.14e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06749 (DUF1218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799104.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799104.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799104.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799104.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799104.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59680683`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	75	A18,A22,A25,A6,B1,B101,B104,B105,B109,B114,B118,B119,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B13,B133,B135,B137,B139,B14,B140,B19,B21,B24,B33,B34,B42,B43,B46,B47,B49,B54,B57,B62,B67,B68,B7,B71,B77,B79,B81,B83,B89,C1,C14,C19,C29,C34,C36,C38,C40,C43,C44,C45,C47,C48,C51,C58,C59,C60,C62,C65,C72,C73,C77,C82,C85,D3,D5,D6,D7
`Chr3:59680732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr3:59681310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:59681458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:59681498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B28
`Chr3:59681520`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A22,B140
`Chr3:59681520`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A22,B140
`Chr3:59681523`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	159	A11,A13,A14,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A3,A4,A5,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B104,B106,B107,B109,B110,B113,B114,B115,B118,B12,B120,B123,B125,B126,B127,B13,B131,B133,B134,B135,B136,B138,B139,B14,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B27,B28,B29,B3,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B47,B49,B5,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B61,B62,B63,B64,B68,B69,B7,B70,B71,B73,B75,B76,B79,B8,B82,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C22,C24,C25,C27,C3,C30,C31,C35,C36,C38,C39,C4,C41,C43,C46,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C6,C61,C62,C63,C65,C67,C69,C72,C74,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C87,D1,D2,D4,D9
`Chr3:59681619`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A15,A16,A20,A24,B11,B111,B117,B120,B122,B124,B128,B131,B132,B139,B20,B24,B27,B36,B38,B39,B45,B48,B88,B93,B99,C10,C14,C20,C21,C26,C34,C36,C51,C53,C55,C75,C86
`Chr3:59681622`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A15,A16,A20,A24,B11,B111,B117,B120,B122,B124,B128,B131,B132,B139,B20,B24,B27,B36,B38,B39,B45,B48,B88,B93,B99,C10,C14,C20,C21,C26,C34,C36,C51,C53,C55,C75,C86
`Chr3:59681691`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	39	A22,A6,A7,B101,B105,B106,B115,B125,B126,B138,B140,B15,B19,B30,B33,B40,B54,B66,B7,B8,B92,C11,C13,C27,C3,C31,C33,C39,C46,C58,C6,C69,C72,C74,C79,C9,D10,D2,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799104.1

243 aa

122

243

DUF1218

PF06749 DUF1218 124-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799104.1`	Pfam	`PF06749`	DUF1218	Family	124	212	4.3e-16	59.8	Protein of unknown function (DUF1218)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943121.1
AACCCACAATTCCAATTCACATTAATTGAGGCATCCATTATGCAAGTGCTAGTAGTGTTGACCACCACTGCACACTACCATTATCGAAGCGTCTATTCTCAATCAAAGAATAAAGCATGCCACTTTCCACCAACAAAAGAAAGCAACGCATTTCAAACTCTATCTTCCCTTCGAGTAAACTCCAAGCCTCCTCCCCTCCATATCAAATCTTCCCCCTCCTCCTCTACCCAAATCCCAAACCCCATGTATATGCAAGCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014939
ATGCAAGTGCTAGTAGTGTTGACCACCACTGCACACTACCATTATCGAAGCGTCTATTCTCAATCAAAGAATAAAGCATGCCACTTTCCACCAACAAAAGAAAGCAACGCATTTCAAACTCTATCTTCCCTTCGAGTAAACTCCAAGCCTCCTCCCCTCCATATCAAATCTTCCCCCTCCTCCTCTACCCAAATCCCAAACCCCATGTATATGCAAGCACTAAACCGATACAGCTTCTCCTCCATCGCCGTCGTCTCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799104.1
MQVLVVLTTTAHYHYRSVYSQSKNKACHFPPTKESNAFQTLSSLRVNSKPPPLHIKSSPSSSTQIPNPMYMQALNRYSFSSIAVVSFALCLAAELKKTKKDDLILDGKLCYLPRSSSFELGIAAVICLSITQVAGSLFIYRKFRPREKRGKFIVTRSLLLLSWIGFGVAVILLSAASSMNQNQAFGEGWLDGECYLVKDGVYVGSAILTLVALGSTLGSGIVAVRRDKAEETQGSLVHAKVDK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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