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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004083`

染色体: Chr03 坐标: 59750304-59753165 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004083`
名称	SmilChr03G004083
描述	alkylated DNA repair protein ALKBH8 homolog
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59750304 - 59753165 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014929`
GeneID	`131014929`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014929`
原始查询	`SmilChr03G004083`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alkylated DNA repair protein ALKBH8 homolog
产物	alkylated DNA repair protein ALKBH8 homolog
Arabidopsis	`AT1G31600` (TRM9) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840048] identity=61.5; qcov=1.03; evalue=5.81e-150; confidence=high
Rice	`Os04g0602700` - identity=59.3; qcov=0.971; evalue=6.9e-144; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0016491 (oxidoreductase activity); GO:0032451 (demethylase activity); GO:0070989 (oxidative demethylation)
KEGG	-
Pfam	PF13532 (2OG-FeII_Oxy_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014929

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799092.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799092.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799092.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057799092.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799092.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59750915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:59750948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B32,C73
`Chr3:59751050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr3:59751124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr3:59751968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B99
`Chr3:59752239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:59752300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B99
`Chr3:59752401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C33
`Chr3:59752657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr3:59752926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B58,C39,C56
`Chr3:59752957`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	47	A11,A19,A22,A23,A4,B102,B115,B118,B131,B136,B15,B18,B26,B33,B35,B40,B41,B44,B49,B53,B58,B6,B60,B68,B69,B74,B76,B84,B88,B9,C10,C28,C3,C30,C31,C39,C42,C47,C54,C56,C57,C59,C60,C79,C81,C9,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799092.1

342 aa

171

342

2OG-FeII_Oxy_2

PF13532 2OG-FeII_Oxy_2 120-323 aa

XP_057799093.1

342 aa

171

342

2OG-FeII_Oxy_2

PF13532 2OG-FeII_Oxy_2 120-323 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799092.1`	Pfam	`PF13532`	2OG-FeII_Oxy_2	Domain	120	323	1.2e-17	65.5	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily
`XP_057799093.1`	Pfam	`PF13532`	2OG-FeII_Oxy_2	Domain	120	323	1.2e-17	65.5	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943109.1
AACTGGATATTAATGTCCTTTAATTATTTTACAACAAAAGGGGCGACGAAAAGTTCTTCCTTTCGCACCATCGCGGCTTCTGCTTGAAGAATAAATCCTTGGAATTTGGTTGCAGTCGAAAATCTTCCTTACGCACCATCAGTGTTGCAGACTTTGAGGGATGGGTTTGCCAAGATTTACAAGCCCTAAGGGAGGGGAAGATGAGTCCAGTCCTCACCTCTATGTGGCTAACTGTGGGCCTGCGGTTGGATTTTCACATG...

XM_057943110.1
AACTGGATATTAATGTCCTTTAATTATTTTACAACAAAAGGGGCGACGAAAAGTTCTTCCTTTCGCACCATCGCGGCTTCTGCTTGAAGAATAAATCCTTGGAATTTGGTTGCAGTCGAAAATCTTCCTTACGCACCATCAGACTTTGAGGGATGGGTTTGCCAAGATTTACAAGCCCTAAGGGAGGGGAAGATGAGTCCAGTCCTCACCTCTATGTGGCTAACTGTGGGCCTGCGGTTGGATTTTCACATGAAACTATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014929
ATGGGTTTGCCAAGATTTACAAGCCCTAAGGGAGGGGAAGATGAGTCCAGTCCTCACCTCTATGTGGCTAACTGTGGGCCTGCGGTTGGATTTTCACATGAAACTATTGCATCTGTATTTGGTATGTACGGAGAAGTCGAGGGTGTCTGTGCTGCTGACGAGAGTGGGACGCGTGTAATTGTCTCCTATCATGATAAGAGCAGTTCACAGGCAGCCATGAAAGCACTGAATAGGCGTCCGTGTTCTAGTCTTGGAGGTCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799092.1
MGLPRFTSPKGGEDESSPHLYVANCGPAVGFSHETIASVFGMYGEVEGVCAADESGTRVIVSYHDKSSSQAAMKALNRRPCSSLGGRTLHIQYAVQSLGKVNNTASVPVSTSASDLDIPGLHLMHDFVTPQEEQELLAAVDDRPWHRLAKRRVQHYGYEFCYDIRNVNTNQYMGELPPFMSPVLERIRSFQALGRAADTSLDQLTVNEYPPGVGLSPHVDTHSAFEELIFSLSLAGPCIMEFRKYTTGAWQENSTSSSDL...

XP_057799093.1
MGLPRFTSPKGGEDESSPHLYVANCGPAVGFSHETIASVFGMYGEVEGVCAADESGTRVIVSYHDKSSSQAAMKALNRRPCSSLGGRTLHIQYAVQSLGKVNNTASVPVSTSASDLDIPGLHLMHDFVTPQEEQELLAAVDDRPWHRLAKRRVQHYGYEFCYDIRNVNTNQYMGELPPFMSPVLERIRSFQALGRAADTSLDQLTVNEYPPGVGLSPHVDTHSAFEELIFSLSLAGPCIMEFRKYTTGAWQENSTSSSDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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