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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004086`

染色体: Chr03 坐标: 59765665-59770710 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004086`
名称	SmilChr03G004086
描述	pectin acetylesterase 8-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59765665 - 59770710 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014923`
GeneID	`131014923`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014923`
原始查询	`SmilChr03G004086`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectin acetylesterase 8-like
产物	pectin acetylesterase 8-like
Arabidopsis	`AT4G19410` (AT4G19410) Pectinacetylesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827682] identity=43.4; qcov=0.938; evalue=4.86e-112; confidence=medium
Rice	`Os02g0702400` - identity=44; qcov=0.997; evalue=1.98e-112; confidence=medium
GO	GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0052793 (pectin acetylesterase activity); GO:0071555 (cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF03283 (PAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014923

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057799084.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799084.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799084.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799084.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799084.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59765875`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A21,A7,B110,B12,B15,B37,B46,B55,B6,B74,B78,C25,C34,C35,C5,C59,C67,C7,C76,D1
`Chr3:59765891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:59767389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C82
`Chr3:59767957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B72
`Chr3:59767963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:59768136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:59768270`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A22,B106
`Chr3:59768270`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A22,B106
`Chr3:59768307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C50
`Chr3:59768450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B132,B36,B68,C26
`Chr3:59768465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B99
`Chr3:59768762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799084.1

390 aa

195

390

PAE

PF03283 PAE 27-383 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799084.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	27	383	3.5e-125	418.7	Pectinacetylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943101.1
GGTTATTCTACATAAATATCTCCTAAAATTTCTCATATATAAAGGCTTCATTTGTACATTTTGGATTTTGTTTTTGAAGGATCAGAAAAAGGGAAGAATTGAAAGACTTTGAAGAGAGTTCAAAGATCGACTATGGCGAGAGGCTCGTTGTTGGCATCACTCCTAATTGCTCAACTAATTATACTTAATTGTGAGGGGATTAACATTAACGAGGTCCCCTTCACATCTGTTGCAGATGCAATACCAGAAAGGGCAGTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014923
ATGGCGAGAGGCTCGTTGTTGGCATCACTCCTAATTGCTCAACTAATTATACTTAATTGTGAGGGGATTAACATTAACGAGGTCCCCTTCACATCTGTTGCAGATGCAATACCAGAAAGGGCAGTTTGTATCGACGGATCCCCAGCGGGCTATCACCATGATCTTGGATTCGGAGACGGAGTTAATAATTGGATAATTTATTTAATGGGTGGTGGATGGTGTAACAATTATTTAACATGCCAGCAAAGAAGGAAGAGTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799084.1
MARGSLLASLLIAQLIILNCEGININEVPFTSVADAIPERAVCIDGSPAGYHHDLGFGDGVNNWIIYLMGGGWCNNYLTCQQRRKSPLGSTKNIKPTNFGGILSPNRGINPDFFNWNRVHVHYCDGSSFIGDTAVIHLGPHLQLRGSRIFRAITNELLEKGMKNAKNALLVGGSAGGLSAILNCDNFRANLGNVSRVKCVSDAGFFIRAKNVPYAGKRERRFNSVVRFHNLASFLPKLCTSRMRSGLCLFPENLVEDIQT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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