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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004088`

染色体: Chr03 坐标: 59775918-59779279 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004088`
名称	SmilChr03G004088
描述	pectin acetylesterase 8-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59775918 - 59779279 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014918`
GeneID	`131014918`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014918`
原始查询	`SmilChr03G004088`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectin acetylesterase 8-like
产物	pectin acetylesterase 8-like
Arabidopsis	`AT4G19420` (AT4G19420) Pectinacetylesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827683] identity=68.5; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0702400` - identity=65.1; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0052793 (pectin acetylesterase activity); GO:0071555 (cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF03283 (PAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014918

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057799067.1`
2	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057799067.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799068.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799068.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799068.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59776519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:59776763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B14
`Chr3:59776769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B123,B133,C15,C47
`Chr3:59777075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr3:59777290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,B69
`Chr3:59777472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,A20
`Chr3:59777662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,D2
`Chr3:59778055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:59778409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C53
`Chr3:59778515`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A6,B101,B126,B33,B54,B7,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799067.1

418 aa

209

418

PAE

PF03283 PAE 41-406 aa

XP_057799068.1

398 aa

199

398

PAE

PF03283 PAE 21-386 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799067.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	41	406	7.4e-171	568.9	Pectinacetylesterase
`XP_057799068.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	21	386	6.2e-171	569.2	Pectinacetylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943085.1
GAAGTCAAACATAACTATATTTTTCATCAAAACATCATGCACACACTCTACAAAAAACAGTTGTCCATGTTGCAGAAAAGATTAAAAAAATAAAAAAAGCCCTACCCATTTAAGAAAATAATAACCTATATAAACTCGATCGTGGAGCAAGAACATTTTACTCGATGAGAATAAGTGTCGGTAGCCTCTCGGGTTCTCTGCAGATGAATAAAAAAATCCGACATTTAAAAAGCTGTTAATATAGTTAGCACCATTGTTTT...

XM_057943084.1
CCATTTAAGAAAATAATAACCTATATAAACTCGATCGTGGAGCAAGAACATTTTACTCGATGAGAATAAGTGTCGGTAGCCTCTCGGGTTCTCTGCAGATGAATAAAAAAATCCGACATTTAAAAAGCTGTTAATATAGTTAGCACCATTGTTTTCTTTTCCTGCTGCTAAATACTCAATCTTTTGCTGTTATTTGACTGATTTCAGCTCCGAATGTACAAGTTCCGAAGCGGGCTTTGGTTTGTTTAAGGTGTTTCTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014918
ATGAGAGATCTAACTAAAGCATTAAGTTTCACTATTTTTCATGTGCGATTGATCAGAATAATGAGGGGAATCTTATTGCAATGGCTGCACATTGTGATGTATGCGGTGATTTTGGTGAGAACTGAAAGCATTTATGTAAATATTACCTATGTTCAAGATGCCGTGGCAAGAGGGGCAGTTTGTCTGGATGGGAGCCCGCCGGCGTACCATTTTGATAAGGGATATGGAACAGGAGTTAACAATTGGTTGATTCAGCTAGA...

LOC131014918
ATGAGGGGAATCTTATTGCAATGGCTGCACATTGTGATGTATGCGGTGATTTTGGTGAGAACTGAAAGCATTTATGTAAATATTACCTATGTTCAAGATGCCGTGGCAAGAGGGGCAGTTTGTCTGGATGGGAGCCCGCCGGCGTACCATTTTGATAAGGGATATGGAACAGGAGTTAACAATTGGTTGATTCAGCTAGAGGGAGGAGGGTGGTGCAACAATGTGACTACATGCCTTGCTCGTAAGGGCAACCGGTTAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799067.1
MRDLTKALSFTIFHVRLIRIMRGILLQWLHIVMYAVILVRTESIYVNITYVQDAVARGAVCLDGSPPAYHFDKGYGTGVNNWLIQLEGGGWCNNVTTCLARKGNRLGSSKQMVKLLAFSGLLGNKARFNPDFYNWNRVKIRYCDGSSFTGDVEAVNPVTGLHYRGARVFLAVMKDLLAKGMKDAENAMLSGCSAGGLAAILHCDNFKNLLPIGTKVKCLSDAGFFINTKDVSGAQHIETYFNDIVTTHGSAKNLPPSCTL...

XP_057799068.1
MRGILLQWLHIVMYAVILVRTESIYVNITYVQDAVARGAVCLDGSPPAYHFDKGYGTGVNNWLIQLEGGGWCNNVTTCLARKGNRLGSSKQMVKLLAFSGLLGNKARFNPDFYNWNRVKIRYCDGSSFTGDVEAVNPVTGLHYRGARVFLAVMKDLLAKGMKDAENAMLSGCSAGGLAAILHCDNFKNLLPIGTKVKCLSDAGFFINTKDVSGAQHIETYFNDIVTTHGSAKNLPPSCTLRMRPSLCFFPQYSARGIRTP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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