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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004089`

染色体: Chr03 坐标: 59786087-59789048 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004089`
名称	SmilChr03G004089
描述	ferredoxin--NADP reductase, root isozyme, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59786087 - 59789048 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014925`
GeneID	`131014925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014925`
原始查询	`SmilChr03G004089`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ferredoxin--NADP reductase, root isozyme, chloroplastic-like
产物	ferredoxin--NADP reductase%2C root isozyme%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G30510` (RFNR2) root FNR 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839930] identity=78.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0784700` (FNR) - identity=78.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00175 (NAD_binding_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799087.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057799087.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799087.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799087.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799087.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59786385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr3:59786397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr3:59786431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B70
`Chr3:59786462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:59786488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B111,B70
`Chr3:59786500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B65,C80
`Chr3:59786542`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B10,B111,B70
`Chr3:59786542`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B10,B111,B70
`Chr3:59786601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B111
`Chr3:59786634`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B10
`Chr3:59786634`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B10
`Chr3:59786653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,C60,D5,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799087.1

377 aa

188

377

NAD_binding_1

PF00175 NAD_binding_1 231-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799087.1`	Pfam	`PF00175`	NAD_binding_1	Domain	231	345	1.3e-25	90.9	Oxidoreductase NAD-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943104.1
TTGGGACACACTCCATAACTGAAGAGCCAAGATTATTGTCCTTTAATTCACTCCAAAAGCTTTGACCCTCACCCGTCAGCAGCCATAGTTGATTACTGATTAATTAATTGTTTAATCAACAATTAACGTCATCTTTATATTTCAACTCTCCGCCTCGTTTCATTAATTTTCTTGTGCTCTTTTCTACTATCGAAGCTCTTTGCTTGATCCGATCATGGCTCATTCTGCTGTTTCTCAAGTCCCAGTTGCGGTCTCCGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014925
ATGGCTCATTCTGCTGTTTCTCAAGTCCCAGTTGCGGTCTCCGTCAATAACGATGTTTCTCTTCGTAAATTCGCGTTCAAGAGCAATCATGTCTCTTTTCATGAAAAATCATGGACCTCTAGTCTGTCTTTGGACTTCAGAGTCGCGAGCTCTCAGTCGAGGGGTCGACCTGTGGTTTGCATGTCGGTGCAACAAGCCAGTAAACCTAAGGTGGCAGTTTCACCTTTGAGCTTGGAAGATGCAAAAGAGCCGCCTCTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799087.1
MAHSAVSQVPVAVSVNNDVSLRKFAFKSNHVSFHEKSWTSSLSLDFRVASSQSRGRPVVCMSVQQASKPKVAVSPLSLEDAKEPPLHLFKNKEPYTGTIVSVERLVGQNAPGETCHIVIDHGGKVPYWEGQSYGIIPPGENPKKPGNPHNVRLYSIASTRYGDSFDSKTASFCVRRAVYYDPETGKEDPSKNGVCSNFLCDSKPGDKVQITGPSGKIMLLPEDDPNATHIMIATGTGVAPYRGYLRRMFMENVPTFKFGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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