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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004099`

染色体: Chr03 坐标: 59881633-59885173 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004099`
名称	SmilChr03G004099
描述	SH3 domain-containing protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59881633 - 59885173 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014927`
GeneID	`131014927`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014927`
原始查询	`SmilChr03G004099`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SH3 domain-containing protein 2-like
产物	SH3 domain-containing protein 2-like
Arabidopsis	`AT1G31440` (AT1G31440) SH3 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840034] identity=47.5; qcov=1.19; evalue=3.17e-128; confidence=high
Rice	`Os03g0266700` - identity=50; qcov=1.06; evalue=4.51e-129; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00018 (SH3_1); PF07653 (SH3_2); PF14604 (SH3_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014927

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799089.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057799089.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057799089.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057799089.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057799089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59881864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B95,C53
`Chr3:59881914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:59882474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B118,B41,B69,B88,C10,C26,C30,C34,C57,C81
`Chr3:59882715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr3:59882741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C50
`Chr3:59882938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:59882940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C9
`Chr3:59883555`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B23
`Chr3:59883555`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B23
`Chr3:59883563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,C23,C32,C68,D9
`Chr3:59883570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C15
`Chr3:59883571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,C33,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799089.1

368 aa

184

368

SH3_2

SH3_1

SH3_9

PF07653 SH3_2 303-355 aa PF00018 SH3_1 304-349 aa PF14604 SH3_9 305-353 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799089.1`	Pfam	`PF07653`	SH3_2	Domain	303	355	3.8e-09	36.8	Variant SH3 domain
`XP_057799089.1`	Pfam	`PF00018`	SH3_1	Domain	304	349	8e-08	32.5	SH3 domain
`XP_057799089.1`	Pfam	`PF14604`	SH3_9	Domain	305	353	4.7e-11	43.1	Variant SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943106.1
GGAGTGGCGGAATCTTGATTCTTGGAGGAAGAAAACTTTTGATTCTTGGGGTAAAGGCAACTTTTTTAGTAGCGAAATTTATGCCCACGATTAAATTCTCTTGGTTTTGTTGGAAATAGTTGTGCTGTGCAAAGTGGGGCAGTTGAATTCCAACGCTCGCTTTCGCCGACACACCCACGCATTTCTACTTTTATTGTCTCTCAACTATCAATTCCACCACATTACGCTGCTCCTCTCTATTATTTTTCCCTCTTCCTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014927
ATGGAAGCAATAAAGAAGCAAGCAAGTAAATTGAGAGAGCAAGTGGCCAGACAGCAACAGGCAATTTTACGACAGCTGGGGCAATTAGGTCATGGAGGGCCTATGATTGATGAAGCTGATGTCGAACTTCATCAGCAACTACAGGATTTGTACAAATCTACAAGGGCTGCCAAGCATTTCCAGAGGGATATTGTACGCGGATTAGAAGGATTAATTTCAACGAGCAAAAAGCAAACTGAGATAGTTAAAAAGTTGGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799089.1
MEAIKKQASKLREQVARQQQAILRQLGQLGHGGPMIDEADVELHQQLQDLYKSTRAAKHFQRDIVRGLEGLISTSKKQTEIVKKLAEDCCKYGIENQDQDSSSPLAKVASDFGTSHASMEDHRERMLGILGYQVFEPLRAQINGAPLEDARHLTHRYDRMRQEFEIQAAEVIRRQSKSRDTSSETALKLKTAEKKLTDLKSSMLSLGREAAAAMSSVEDQQQETTFQKLLTMVNAERSYHQNVIAILEKLHSEMILDEET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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