当前解析结果
SmilChr03G004102| 统一新 Gene ID | SmilChr03G004102 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G004102 |
| 描述 | protein MOS2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 59908999 - 59912318 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131014966 |
|---|---|
| GeneID | 131014966 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014966 |
| 原始查询 | SmilChr03G004102 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein MOS2-like |
| 产物 | protein MOS2-like |
| Arabidopsis | AT1G33520 (MOS2)D111/G-patch domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840246] identity=45.6; qcov=1.05; evalue=1.29e-115; confidence=high |
| Rice | Os03g0253500- identity=33.1; qcov=1.05; evalue=2.85e-67; confidence=low |
| GO | GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005681 (spliceosomal complex) |
| KEGG | smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF01585 (G-patch); PF12656 (G-patch_2); PF25088 (GPKOW_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014966 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057799125.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799125.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057799125.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057799125.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057799125.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057799125.1PF12656
G-patch_2 142-198 aa
PF01585
G-patch 156-197 aa
PF25088
GPKOW_C 345-452 aa
XP_057799126.1PF12656
G-patch_2 142-198 aa
PF01585
G-patch 156-197 aa
PF25088
GPKOW_C 345-452 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057799125.1 |
Pfam | PF12656 |
G-patch_2 | Domain | 142 | 198 | 4.9e-19 | 68.8 | G-patch domain |
XP_057799125.1 |
Pfam | PF01585 |
G-patch | Family | 156 | 197 | 1e-06 | 29.2 | G-patch domain |
XP_057799125.1 |
Pfam | PF25088 |
GPKOW_C | Domain | 345 | 452 | 4.4e-40 | 136.8 | GPKOW C-terminal domain |
XP_057799126.1 |
Pfam | PF12656 |
G-patch_2 | Domain | 142 | 198 | 4.9e-19 | 68.8 | G-patch domain |
XP_057799126.1 |
Pfam | PF01585 |
G-patch | Family | 156 | 197 | 1e-06 | 29.2 | G-patch domain |
XP_057799126.1 |
Pfam | PF25088 |
GPKOW_C | Domain | 345 | 452 | 4.4e-40 | 136.8 | GPKOW C-terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
15 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。