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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004113`

染色体: Chr03 坐标: 60037552-60041522 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004113`
名称	SmilChr03G004113
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60037552 - 60041522 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014981`
GeneID	`131014981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014981`
原始查询	`SmilChr03G004113`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial
产物	protein WHAT'S THIS FACTOR 9%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G48040` (AT5G48040) Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834855] identity=57.7; qcov=0.927; evalue=2.86e-151; confidence=high
Rice	`Os02g0526600` - identity=48.6; qcov=0.831; evalue=2.26e-86; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF11955 (PORR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057799143.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057799143.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057799143.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799143.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799143.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60037848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr3:60037916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:60037926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:60038027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,C60
`Chr3:60038079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr3:60038192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B52,B59,C24
`Chr3:60038207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B6,B76,C63,C79
`Chr3:60038376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B69
`Chr3:60038404`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A10,A18,B1,B101,B117,B126,B33,B54,B7,B72,B93,B99,C40,C58,C85,D10
`Chr3:60038406`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	182	A1,A10,A11,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A22,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B110,B112,B113,B115,B117,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B126,B127,B129,B130,B131,B132,B134,B135,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B24,B27,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B57,B58,B59,B61,B62,B65,B68,B7,B70,B71,B72,B73,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B84,B87,B88,B89,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C16,C17,C2,C20,C23,C24,C25,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C57,C58,C59,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C68,C69,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C80,C82,C84,C85,C86,C9,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr3:60038408`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	171	A1,A10,A11,A14,A15,A19,A2,A20,A22,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B102,B103,B106,B107,B108,B110,B112,B113,B115,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B126,B127,B129,B130,B131,B132,B134,B135,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B22,B24,B27,B29,B3,B30,B32,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B55,B57,B58,B59,B61,B62,B65,B68,B7,B70,B71,B73,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B84,B87,B88,B89,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C16,C17,C2,C20,C23,C24,C25,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C57,C59,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C68,C69,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C80,C82,C84,C86,C9,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr3:60038416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B6,B60,B76,C63,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799143.1

426 aa

213

426

PORR

PF11955 PORR 37-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799143.1`	Pfam	`PF11955`	PORR	Family	37	364	6.2e-115	384.3	Plant organelle RNA recognition domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943160.1
AAATTCTATTTTTTTCAACTAGATTTAAAAGAAAGAAAGAAAAAACTTGCATGAAATGATGAAAATATGCAATCGGGGGGAAGGCTACCTCTCCGACTCCCCTAAAACCAGTCTTTGATAGTGCATATCTTGGCCCAATCGTCTCATCGAAATTGATCTCTCTGTGAAGACGGCGTGTTGTCTGCTTCAACTTCACAATTTCAGTCAGTGATGTAAAAATCGGAAGCATTTGTCTGCCACCTCTTTTGTGTCATGTACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014981
ATGTTCAACCAAAGGCGGAATTTCATCAATCTTGCTTCCGCCGCCGCCTACTTCCACCCGTCCATCCACATTCAGGCGCGCAATCTCGTCAACGTGAAGCTCAAATGGGTAAAAGACGCCGCTCTTGATCCCGTAGTTTCTTGCGGCGTTCACCTCAAAGCTACTTGTATCCTCATCTCTCTCATAGCCTCCGCCCCCAATCTCTCTCTCCCCATCCACCGCCTCTCCCGCCACCGCCGCCAGCTCGGCCTCCCTTCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799143.1
MFNQRRNFINLASAAAYFHPSIHIQARNLVNVKLKWVKDAALDPVVSCGVHLKATCILISLIASAPNLSLPIHRLSRHRRQLGLPSDLKLSTFIRRFPNIFQEFHLPDSSGTPVPWYRLSPEASDVCSQELRVVCEDCYVDILNRLRKLLMLTRERLLPLQTIDQLWWDLGLPFDFGDKFIRKHPDLFSLVKLPDDRVGLKLLVWDDRLALSHLESRSSISLRKNESLMFPIGFTRGFGLKKKCMEWLNEWQKLPYTSPY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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