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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004116`

染色体: Chr03 坐标: 60055971-60059573 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004116`
名称	SmilChr03G004116
描述	uncharacterized SmilChr03G004116
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60055971 - 60059573 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014985`
GeneID	`131014985`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014985`
原始查询	`SmilChr03G004116`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0137600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0137600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G10910` (AT5G10910) mraW methylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830958] identity=58.7; qcov=0.895; evalue=3.3e-136; confidence=high
Rice	`Os02g0137600` - identity=58.4; qcov=0.895; evalue=5.63e-149; confidence=high
GO	GO:0070475 (rRNA base methylation); GO:0071424 (rRNA (cytosine-N4-)-methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01795 (Methyltransf_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014985

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057799148.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057799148.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799148.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799148.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799148.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60056118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C82
`Chr3:60057225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:60057226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C34
`Chr3:60057244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:60057343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C82
`Chr3:60057854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C9
`Chr3:60058719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B81,B94,D1
`Chr3:60059128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr3:60059180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B136,C31,C40,D6
`Chr3:60059300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:60059517`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	85	A11,A13,A14,A18,A22,A25,A5,A7,B107,B109,B11,B114,B118,B123,B125,B126,B128,B13,B133,B137,B14,B15,B16,B17,B2,B23,B32,B33,B34,B36,B47,B51,B52,B56,B57,B6,B60,B62,B67,B68,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B80,B84,B87,B96,B99,C1,C14,C19,C2,C21,C22,C27,C32,C34,C35,C39,C4,C41,C47,C49,C50,C53,C59,C61,C62,C64,C66,C67,C68,C7,C70,C83,D1,D2,D3,D4,D9
`Chr3:60059543`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	70	A11,A18,A22,A25,A5,A7,B107,B11,B118,B123,B126,B128,B13,B133,B134,B15,B16,B17,B2,B23,B32,B33,B34,B36,B37,B47,B52,B56,B57,B6,B62,B68,B70,B71,B73,B74,B75,B77,B78,B84,B87,B96,B99,C1,C14,C19,C2,C27,C32,C34,C35,C39,C4,C41,C47,C49,C50,C53,C59,C61,C62,C67,C68,C7,C70,D1,D2,D3,D4,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799148.1

463 aa

232

463

Methyltransf_5

PF01795 Methyltransf_5 93-430 aa

XP_057799149.1

430 aa

215

430

Methyltransf_5

PF01795 Methyltransf_5 93-429 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799148.1`	Pfam	`PF01795`	Methyltransf_5	Family	93	430	5.7e-84	282.9	MraW methylase family
`XP_057799149.1`	Pfam	`PF01795`	Methyltransf_5	Family	93	429	5.5e-84	283.0	MraW methylase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943165.1
CAAATTATTTCCTATCGTCTTCTTCACCGACACACCCAATGGCCTTGCCAGCGGCCTCAGCTTCTGCAAAATCACTTTTCAAAAAGCTGCTGCTCTTACATTCTCCACACAAATTCTCTACCGCTCGTTTCTCTGCTCCCGCCACAGCTCGATCAGTAAATAGTGCTCTCAGAAACAGAGGCAAAAGCAAAATCAATAGAGAATCGAATCAGAAGCAGAAGCAGAAAGCTGAGCTGTTAGTGAAGAGGCGAACGCGGTCG...

XM_057943166.1
AAATTATTTCCTATCGTCTTCTTCACCGACACACCCAATGGCCTTGCCAGCGGCCTCAGCTTCTGCAAAATCACTTTTCAAAAAGCTGCTGCTCTTACATTCTCCACACAAATTCTCTACCGCTCGTTTCTCTGCTCCCGCCACAGCTCGATCAGTAAATAGTGCTCTCAGAAACAGAGGCAAAAGCAAAATCAATAGAGAATCGAATCAGAAGCAGAAGCAGAAAGCTGAGCTGTTAGTGAAGAGGCGAACGCGGTCGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014985
ATGGCCTTGCCAGCGGCCTCAGCTTCTGCAAAATCACTTTTCAAAAAGCTGCTGCTCTTACATTCTCCACACAAATTCTCTACCGCTCGTTTCTCTGCTCCCGCCACAGCTCGATCAGTAAATAGTGCTCTCAGAAACAGAGGCAAAAGCAAAATCAATAGAGAATCGAATCAGAAGCAGAAGCAGAAAGCTGAGCTGTTAGTGAAGAGGCGAACGCGGTCGGATAGAGAGCTCGACGAGGAGGTGTTCTCGAAGCACTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799148.1
MALPAASASAKSLFKKLLLLHSPHKFSTARFSAPATARSVNSALRNRGKSKINRESNQKQKQKAELLVKRRTRSDRELDEEVFSKHYGNESSAAHVPVMLGEVLDAFASVSLKSFVDCTLGAGGHSAAIIQAHPEMEFYVGFDVDPVAHQIALDQINNVLDKDSGPSRAHLQVHTLLKNFKSIKSALHDIDGNRSPGVQGILMDLGMSSMQVNNAERGFSVLCNGPLDMRMNPQASLKAEDILNLWPDAELGRILRDYGE...

XP_057799149.1
MALPAASASAKSLFKKLLLLHSPHKFSTARFSAPATARSVNSALRNRGKSKINRESNQKQKQKAELLVKRRTRSDRELDEEVFSKHYGNESSAAHVPVMLGEVLDAFASVSLKSFVDCTLGAGGHSAAIIQAHPEMEFYVGFDVDPVAHQIALDQINNVLDKDSGPSRAHLQVHTLLKNFKSIKSALHDIDGNRSPGVQGILMDLGMSSMQVNNAERGFSVLCNGPLDMRMNPQASLKAEDILNLWPDAELGRILRDYGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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