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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004119`

染色体: Chr03 坐标: 60065556-60069317 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004119`
名称	SmilChr03G004119
描述	uncharacterized SmilChr03G004119
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60065556 - 60069317 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014990`
GeneID	`131014990`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014990`
原始查询	`SmilChr03G004119`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828432]; symbol=AT4G23330; hit=AT4G23330; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828432]; symbol=AT4G23330; hit=AT4G23330; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G23330` (AT4G23330) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828432] identity=63.3; qcov=0.811; evalue=2.73e-48; confidence=medium
Rice	`Os07g0483400` (OJ1136_F08.108) - identity=56; qcov=0.736; evalue=4.2e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10157 (BORCS6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014990

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057799158.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057799158.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057799158.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057799158.1`
5	Autophagic vesicle	Autophagic vesicle	0.20000	`XP_057799158.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60065834`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C36
`Chr3:60065834`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C36
`Chr3:60066236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,D5
`Chr3:60068338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B75,C25
`Chr3:60068944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:60068987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:60069010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799158.1

148 aa

148

BORCS6

PF10157 BORCS6 44-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799158.1`	Pfam	`PF10157`	BORCS6	Family	44	138	2.1e-22	79.9	BLOC-1-related complex sub-unit 6 C-terminal helix

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943175.1
TATATTTTTCTAAATCACACATTAGCCCACAAAAACCTTCTTTTCTTCTTTTCTTGTTTCGTTAGCGTCATTGCTAAACCTCAACCGAGCCGTGAAAGCAAGCAAGCCGAGTTTTAAAGCGCCACCCTTTTCCTTTTCCTCTTTCGTCGCTCAAGCCTTTTCTATGGAGAACGAGGAAACGATTAACGACAAATCAGAGGCCGAAGTTTCGGATGCGGTGGTTCATTGCCATTTCGACGGTGGCGGTGGCCAGGCAGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014990
ATGGAGAACGAGGAAACGATTAACGACAAATCAGAGGCCGAAGTTTCGGATGCGGTGGTTCATTGCCATTTCGACGGTGGCGGTGGCCAGGCAGATGCAAAATCGCTCGGTCGGAGGAAGGATATTCTGAAAGCTCTGGAGGCAGTGGAGAGAGATTCGGCTGCCATCGCTGAGAGCTTCTCCTCTCTCTTCGGCTCTCTCCGTCACTCGCTCTCGCAGGCTACTGGCTCTACGGTTGAACACATGAACTGCTTCAGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799158.1
MENEETINDKSEAEVSDAVVHCHFDGGGGQADAKSLGRRKDILKALEAVERDSAAIAESFSSLFGSLRHSLSQATGSTVEHMNCFSDATGRLQECVLDAATKGNRYINSCLRLNEEMKDMDALATKLKILRRHVDALDSVVNRVVRLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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