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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004125`

染色体: Chr03 坐标: 60094748-60095865 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004125`
名称	SmilChr03G004125
描述	thaumatin-like protein
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60094748 - 60095865 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014994`
GeneID	`131014994`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014994`
原始查询	`SmilChr03G004125`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thaumatin-like protein
产物	thaumatin-like protein
Arabidopsis	`AT5G02140` (AT5G02140) Pathosis-related thaumatin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831881] identity=79; qcov=0.903; evalue=4.03e-122; confidence=high
Rice	`Os11g0706600` - identity=67.1; qcov=0.895; evalue=3.2e-102; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00314 (Thaumatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014994

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057799160.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057799160.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799160.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799160.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799160.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60095042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C53
`Chr3:60095054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	67	A1,A16,A5,A8,B10,B103,B104,B108,B110,B114,B117,B120,B121,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B134,B135,B138,B16,B22,B25,B30,B31,B49,B57,B64,B78,B79,B8,B83,B9,B90,B94,C10,C11,C14,C17,C19,C21,C22,C23,C25,C26,C28,C33,C34,C38,C39,C4,C42,C46,C49,C6,C69,C7,C72,C73,C86,C87,D1,D11,D9
`Chr3:60095070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C30,C71,D11
`Chr3:60095083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,D4
`Chr3:60095175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B1
`Chr3:60095175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:60095183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr3:60095207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B24,B41,B61
`Chr3:60095213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C16,C28,C33,C67
`Chr3:60095214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr3:60095222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:60095225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799160.1

248 aa

124

248

Thaumatin

PF00314 Thaumatin 33-246 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799160.1`	Pfam	`PF00314`	Thaumatin	Domain	33	246	6.3e-80	268.5	Thaumatin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943177.1
GTAGCCTCTAGCAGAGTTCTTCTACTTTAAATTGAGCATCCATCCCTCGCAGAAGAAGCACAAGTTTTAGTTTTGGTACAGATTGATTTAACAATGCTTCCTATTTTCCGATATGGATTCTTCATTACTATCACCATAGTCCTCTCTCTCACTAGAACAAATGGCAGTGGATATCAGCTCATCGTAGTAAACAACTGCAACGGGAGCATATGGCCCGGAATCCAGGGCGGCGCGGGGCAGCGAACCCTCAGTGACGGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014994
ATGCTTCCTATTTTCCGATATGGATTCTTCATTACTATCACCATAGTCCTCTCTCTCACTAGAACAAATGGCAGTGGATATCAGCTCATCGTAGTAAACAACTGCAACGGGAGCATATGGCCCGGAATCCAGGGCGGCGCGGGGCAGCGAACCCTCAGTGACGGTGGCTTCCTCCTCAGCAGCGGTGGTGAGGTAGCCATCGACGTCCCCGAGAAGTGGTCAGGCCGGTTGTGGGGAAGGCAGTTCTGCAACTTCGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799160.1
MLPIFRYGFFITITIVLSLTRTNGSGYQLIVVNNCNGSIWPGIQGGAGQRTLSDGGFLLSSGGEVAIDVPEKWSGRLWGRQFCNFDSNGKGSCVTGDCSGQLRCQGMGGAPPATVVEMTLGSSASPLHFYDVSLVDGFNLPVSMKPIGGGVGCGVASCEVDLNVCCPSALEVRVGGRVVGCKSACLAMQSPKYCCTGQYADPKTCKPTVFANLFKAICPKAYSYAFDDSSSLNKCRAKRYVVTFCPPQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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