当前解析结果
SmilChr03G004138| 统一新 Gene ID | SmilChr03G004138 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G004138 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G004138 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 60224007 - 60233480 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131015004 |
|---|---|
| GeneID | 131015004 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015004 |
| 原始查询 | SmilChr03G004138 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015004 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057799181.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057799181.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057799181.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799181.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057799181.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:60231501 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,B77 |
Chr3:60231517 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C13 |
Chr3:60231630 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B9,C30,C54 |
Chr3:60231706 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B99,D11 |
Chr3:60231727 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr3:60231756 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr3:60231757 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr3:60231775 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B82,C63,C79 |
Chr3:60231776 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B135,B23,B77 |
Chr3:60231776 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B135,B23,B77 |
Chr3:60231791 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:60231797 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。