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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004142`

染色体: Chr03 坐标: 60258644-60259399 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004142`
名称	SmilChr03G004142
描述	uncharacterized SmilChr03G004142
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60258644 - 60259399 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019081`
GeneID	`131019081`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019081`
原始查询	`SmilChr03G004142`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=26.2; qcov=0.805; evalue=5.55e-12; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=27.3; qcov=0.948; evalue=1.05e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019081

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803747.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803747.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803747.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803747.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803747.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60258650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C74,D4
`Chr3:60258659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:60258669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A2,A5,B10,B118,B17,B33,B40,B48,B50,B54,B93,B94,C16,C29,C31,C33,C58,C80,C9,D3
`Chr3:60258676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B122
`Chr3:60258676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr3:60258685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:60258697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C11
`Chr3:60258780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:60258807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,C74,D2
`Chr3:60258826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B70,C74,D2
`Chr3:60258832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr3:60258836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803747.1

251 aa

126

251

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 57-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803747.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	57	150	2e-18	67.5	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947764.1
ATGGGGGAATGGGTTGATGGAGTGTGGGTGTGGAAGTTAGAGTGGAATCGGGAGATTCGAGACAGAGATGCACATCATATTAATAACCTTCAAGTTTTTCTTGATGATTATTCTGTAAAAGTTGGCGAAGCAGATGGCTGGAAATGGAAGCTTACTTCAAATGGAATTTTCAATGTCAACTCCGCTTACAAAGCGATCTGCCATCACTCCTGCTCAAACACCCAACAAATTTATATTCCAGAGTGTAGTAGTATTTGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019081
ATGGGGGAATGGGTTGATGGAGTGTGGGTGTGGAAGTTAGAGTGGAATCGGGAGATTCGAGACAGAGATGCACATCATATTAATAACCTTCAAGTTTTTCTTGATGATTATTCTGTAAAAGTTGGCGAAGCAGATGGCTGGAAATGGAAGCTTACTTCAAATGGAATTTTCAATGTCAACTCCGCTTACAAAGCGATCTGCCATCACTCCTGCTCAAACACCCAACAAATTTATATTCCAGAGTGTAGTAGTATTTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803747.1
MGEWVDGVWVWKLEWNREIRDRDAHHINNLQVFLDDYSVKVGEADGWKWKLTSNGIFNVNSAYKAICHHSCSNTQQIYIPECSSIWKSAAPYKAKVTAWRILMGRMPTCDNLIRRQIEIPAPEAVCVFCQNQVETCNHLLFSCNKSAEIWYDVIFWLGKKSVFHCSAREHFTAFMNIGDKGDGYFLRSVWLCIVWCIWKCRNECKFNQGQWNKDKMIREIKTRLWTWKTAYNLKNSTGDFRSWFSGFGILG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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